Theo ông Kosei Hashiguchi (nhóm dự án JICA), trong quá trình xem xét những xu thế về khí hậu trong quá khứ, dự án này đã mô phỏng lũ và xâm nhập mặn với các kịch bản BĐKH cũng như nước biển dâng. Trong tương lai, cứ 1 thập niên, nhiệt độ tăng từ 0,2 - 0,3 độ C; nước biển dâng từ 8-9m, lượng mưa tăng từ 0,4 - 0,6% sẽ làm giảm năng suất lúa từ 10 - 15%.
Theo đó, 2 tỉnh Kiên Giang và Sóc Trăng sẽ bị thiệt hại lớn về cây lúa, thiệt hại về cây ăn trái lớn nhất là ở Tiền Giang, Bến Tre, Trà Vinh và Cà Mau. Từ đó, dự án đã xác định các tiểu dự án ưu tiên để giúp các tỉnh ven biển này thích ứng với BĐKH, như: xây dựng cửa ngăn mặn, cải tạo và xây dựng đê biển
