Tuy nhiên, hoạt động kiểm tra sức khỏe vẫn còn một số hạn chế như kết quả kiểm tra sức khỏe được ghi trên phiếu giấy, gây khó khăn trong việc tổng hợp, báo cáo và quản lý. Bên cạnh đó, tại các cơ sở khám bệnh, chữa bệnh, nhân sự thực hiện kiểm tra sức khỏe học sinh chưa đáp ứng đầy đủ, quy trình và điều kiện của các cơ sở kiểm tra sức khỏe học sinh chưa có sự thống nhất.
Tính đến thời điểm hiện nay, các trường từ mầm non, tiểu học, trung học cơ sở đến trung học phổ thông đã kiểm tra sức khỏe 490.139 học sinh thuộc 1.007 trường, trong đó 86.600 học sinh mầm non, 179.268 học sinh tiểu học, 135.293 học sinh trung học cơ sở và 87.380 học sinh phổ thông. Chương trình kiểm tra sức khỏe đang được các trường tiếp tục triển khai trong thời gian tiếp theo.
Kết quả sơ bộ cho thấy, có đến là 226.550 học sinh bị tật khúc xạ (chiếm tỷ lệ cao nhất là 46,22%), 100.924 học sinh bị thừa cân (20,59%), 84.175 béo phì (17,11%), 44.417 sâu răng (9,06%), vẹo cột sống là 10.058 (2,05%), còng cột sống là 3.386 (0,69%).
Theo các cấp học, tỷ lệ các bệnh tật học đường phân bổ có khác nhau. Ở cấp mầm non và tiểu học, tỷ lệ trẻ bị sâu răng chiếm cao nhất, kế đến là thừa cân, béo phì, tật khúc xạ, còng cột sống, vẹo cột sống. Trong khi đó, cấp trung học cơ sở và trung học phổ thông thì tỷ lệ học sinh mắc tật khúc xạ chiếm cao nhất, kế đến là thừa cân...
Sở Y tế TP Hồ Chí Minh cho biết, chuyển đổi số công tác kiểm tra sức khỏe học sinh có ý nghĩa đặc biệt quan trọng vừa giúp theo dõi liên tục tình trạng sức khỏe của mỗi học sinh từ cấp mầm non đến cấp trung học phổ thông. Dữ liệu sức khỏe của học sinh sẽ được tích hợp liên thông vào hồ sơ sức khỏe ngay khi ngành y tế triển khai hồ sơ sức khỏe. Ngoài ra, nhờ chuyển đổi số nên mô hình bệnh tật học đường nhanh chóng được nhận diện, làm cơ sở quan trọng để ngành Y tế triển khai các can thiệp y tế học đường.
Cảnh báo khoảng 3 triệu trẻ em Việt Nam mắc tật khúc xạ 
70% trẻ lác mắt có kèm theo tật khúc xạ không được chỉnh kính 
