Theo cáo trạng, ngày 25/12/2006, ông Tuyên chỉ đạo nhân viên dưới quyền sử dụng séc tiền mặt rút 4,5 tỷ đồng tại ngân hàng để sử dụng cá nhân. Nhằm che giấu việc làm trên, ông Tuyên thông báo với bộ phận kế toán hạch toán khoản tiền này thành chi tạm ứng cho Công ty cổ phần Thương mại đầu tư Cửu Long (Công ty Cửu Long) để thực hiện dự án Nhà máy nhiệt điện Sông Hồng - Nam Định.
Qua đối chiếu công nợ, Công ty Cửu Long xác nhận không tạm ứng số tiền trên, lúc đó ông Tuyên mới thừa nhận đã sử dụng cá nhân và chỉ đạo ông Côn (lúc đó là Kế toán trưởng) thực hiện việc lập các chứng từ kế toán, hạch toán khống sang Công ty Vinaha (một Công ty do ông Tuyên thành lập và chiếm cổ phần chi phối) để che giấu việc tham ô tài sản.
Trước đó, trong phiên tòa xét xử sơ thẩm vụ án cố ý làm trái xảy ra tại Tập đoàn Vinashin, Tòa án nhân dân TP Hải Phòng đã tuyên phạt Nguyễn Văn Tuyên 16 năm tù, Đỗ Đình Côn 10 năm tù với cùng tội danh "Cố ý làm trái qui định của Nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng".
Như vậy, ông Tuyên và ông Côn sẽ phải ra tòa lần thứ 2 để lĩnh thêm hình phạt của pháp luật vào tội trạng của hai ông này