Theo đó, Dự án Luật dự kiến sửa đổi 31 Điều trong tổng số 120 Điều của Luật hiện hành, liên quan đến 3 nhóm vấn đề với 20 nội dung. Nhóm thứ nhất là về đơn giản hóa thủ tục hành chính thuế. Việc đơn giản này được thể hiện ở những sửa đổi như người nộp thuế quy mô nhỏ và vừa sẽ được giảm tần suất kê khai thuế từ 12 lần/năm xuống còn 4 lần/năm. Việc sửa đổi này sẽ giúp giảm chi phí hành chính cho người nộp thuế, dãn luôn tiền nộp thuế, vừa đáp ứng được yêu cầu thông lệ quốc tế về nâng cao tính hấp dẫn của môi trường kinh doanh. Bên cạnh đó, nhóm đơn giản hóa thủ tục hành chính còn rút ngắn thời hạn hoàn thuế, bỏ chứng từ nộp thuế, tăng hoàn thuế trước, kiểm tra sau…
Ở nhóm thứ 2 là sửa đổi để phục vụ mục tiêu cải cách, hiện đại hóa và hội nhập, phù hợp với thông lệ quốc tế. Trong nhóm này, dự thảo sửa đổi 4 nội dung là bổ sung nguyên tắc quản lý rủi ro trong công tác quản lý thuế; bổ sung cơ chế thỏa thuận trước về phương pháp xác định giá trong chống chuyển giá; bổ sung quy định về cơ chế phân loại mã số, xác định trị giá, xác định xuất xứ hàng hóa trước khi làm thủ tục xuất, nhập cảnh; và mở rộng phạm vi thu thập, khai thác thông tin về người nộp thuế từ nguồn nước ngoài theo các hiệp định, hiệp ước đã ký.
Riêng nhóm 3 là nhóm vấn đề về nâng cao hiệu lực, hiệu quả của quản lý thuế để phù hợp với thực tế và các văn bản pháp luật có liên quan. Trong nhóm vấn đề này có 10 nội dung được sửa đổi, bổ sung tập trung vào việc hoàn thiện hơn nữa công tác quản lý nợ thuế, cưỡng chế thuế, xử lý vi phạm pháp luật về thuế nhằm bám sát thực tế, khuyến khích, động viên, hỗ trợ người nộp thuế khắc phục khó khăn và điều chỉnh những bất cập của Luật hiện hành.
Cụ thể, sẽ thu hẹp phạm vi áp dụng thời gian ân hạn nộp thuế đối với hàng hóa xuất, nhập khẩu, gia hạn nộp thuế, xóa nợ tiền thuế, tiền phạt, thay đổi thứ tự các biện pháp cưỡng chế thi hành quyết định hành chính thuế, phân biệt chi tiết về cấp độ vi phạm với các hành vi nộp chậm, khai thiếu, trốn thuế…
Đặc biệt, một nội dung mang lại nhiều quyền lợi cho người nộp thuế đó là đối với các doanh nghiệp (DN) có số tiền nợ thuế lớn hoặc bị truy thu với số tiền lớn vượt quá khả năng DN có thể thanh toán trong một lần khi có khó khăn về tài chính trong ngắn hạn, Luật Thuế mới sẽ cho phép DN được nộp dần số tiền nợ thuế làm nhiều lần trong 12 tháng, nhưng phải trả lãi chậm nộp tiền thuế mức 0,05%/ngày (18%/năm) trên cơ sở cam kết của người nộp thuế và bảo lãnh của ngân hàng thương mại...
