Sự việc được phát hiện từ đơn của bà Cao Thị Thinh (mẹ bị can Trần Cao Hải), trú tại thị trấn Yên Bình, huyện Yên Bình tố cáo KSV Nhung - người được phân công kiểm sát điều tra và giữ quyền công tố vụ án Trần Cao Hải là bị can phạm tội "Cố ý gây thương tích". Theo đơn tố cáo, thì bà Thinh bị KSV Nhung ép buộc phải chi 25 triệu đồng để con bà được tha.
Sau khi nhận được đơn tố cáo, cơ quan tố tụng huyện Yên Bình xác minh lại vụ việc và xác định: Ngày 18/6/2008, Trần Cao Hải và Bùi Đức Quang xảy ra xô xát. Hậu quả anh Quang bị Hải dùng dao quắm chém gây thương tích. Theo kết luận tỷ lệ thương tật của anh Quang là 37% (trong đó vết thương ở sườn trái đã phải cắt bỏ lá lách chiếm 31% thương tật).
Ngày 20/11/2008, Cơ quan CSĐT Công an huyện Yên Bình đã kết luận điều tra và chuyển sang Viện KSND huyện Yên Bình đề nghị truy tố Hải với tội danh trên. Tuy nhiên sau đó, KSV Nhung đã làm văn bản đề xuất với lãnh đạo Viện KSND huyện Yên Bình xem xét lại kết luận điều tra vì có đơn của bà Thinh cho rằng Hải chỉ dùng dao chém một nhát, anh Quang giằng được dao chạy đi và bị vấp ngã vào đống gỗ.
Đề xuất này được ông Cường, nguyên Phó Viện trưởng Viện KSND huyện Yên Bình ký đồng ý. Sau đó, KSV Nhung đã "lái" vụ việc gây thương tích theo hướng: Thương tích 31% là do anh Quang "tự ngã" vào đống gỗ. Để hợp thức hồ sơ theo hướng này, KSV Nhung đã hướng dẫn cho các bên liên quan viết tường trình và khai có nội dung trái với bản chất sự thật của vụ án; yêu cầu bị hại Bùi Đức Quang ký khống vào biên bản ghi lời khai để sau đó tự ghi vào biên bản nhằm làm sai lệch hồ sơ vụ án.
Ngày 18/12/2008, Trần Cao Hải được ông Lê Việt Cường - Phó Viện trưởng Viện KSND huyện Yên Bình ký quyết định thay đổi biện pháp ngăn chặn, theo đề xuất của KSV Nhung.
Sau một ngày, vụ án cố ý gây thương tích do Hải là bị can đã được ông Cường - Phó Viện trưởng ký quyết định đình chỉ vụ án, đình chỉ bị can. Sau này, cơ quan điều tra hình sự Viện KSND tối cao xác định "Đơn xin miễn truy cứu trách nhiệm hình sự" của bị hại lại được viết sau ngày KSV Nhung đề xuất thay đổi biện pháp ngăn chặn?
Khi vụ việc bị phát hiện, cơ quan tố tụng huyện Yên Bình đã phục hồi điều tra, truy tố và xét xử đối với Trần Cao Hải. Theo đó, Hải đã bị TAND tỉnh Yên Bái xử phúc thẩm tuyên phạt Hải 5 năm tù giam.
Quá trình điều tra, cơ quan điều tra hình sự Viện KSND tối cao đã làm rõ hành vi vi phạm pháp luật của kiểm sát viên Nhung. Tuy nhiên, tố cáo của bà Thinh về việc KSV này nhận hối lộ 25 triệu đồng để "chạy án" cho con bà là không đủ cơ sở.
Ngoài ra, cơ quan điều tra hình sự Viện KSND tối cao đã kiến nghị xử lý hành chính gửi Viện trưởng Viện KSND tỉnh Yên Bái đối với ông Lê Việt Cường, nguyên Phó Viện trưởng và ông Lê Xuân Hùng, Viện trưởng Viện KSND huyện Yên Bình về trách nhiệm của hai ông này trong việc để xảy ra vi phạm pháp luật của KSV Vi Thị Hồng Nhung