Chương trình nhằm cung cấp luận cứ khoa học, giải pháp và mô hình công nghệ giúp địa phương chủ động thích ứng, đồng thời nâng cao năng lực kinh tế - xã hội môi trường toàn vùng.
Nội dung trọng tâm gồm: Nghiên cứu cơ sở dữ liệu và chính sách phát triển theo hướng kinh tế xanh, kinh tế tuần hoàn; chuyển giao công nghệ nông nghiệp và thủy sản thích ứng hạn - mặn; xây dựng mô hình nông thôn mới xanh, đô thị và khu công nghiệp thông minh; phát triển hệ thống cấp nước, giao thông đường thủy và cảnh báo sụt lún thông minh; tích hợp dữ liệu liên ngành phục vụ quản lý vùng.
Chương trình đặt mục tiêu ít nhất 80% kết quả được ứng dụng thực tiễn và khuyến khích mạnh mẽ sự tham gia của doanh nghiệp, chuyên gia quốc tế và địa phương bảo đảm nghiên cứu đi vào đời sống. Với vai trò chủ trì, Bộ KH&CN đang tổ chức đặt hàng nhiệm vụ, huy động đội ngũ nhà khoa học trong và ngoài nước, đồng thời tạo cơ chế để doanh nghiệp và địa phương đồng hành ngay từ đầu. Thành công của KC.15/21-30 sẽ góp phần hiện thực hóa các nghị quyết chiến lược dành cho ĐBSCL, hình thành những hạ tầng công nghệ mới, từ hệ thống ngăn mặn cấp nước thông minh đến cảnh báo sụt lún tức thời.
Khi khoa học và công nghệ được ứng dụng sâu rộng, từ giống cây trồng thích nghi đến chế biến, chuỗi liên kết, thương mại điện tử và đô thị xanh, ĐBSCL sẽ tiến gần hơn mục tiêu trở thành vùng kinh tế trọng điểm, văn minh, sinh thái và bền vững, mang bản sắc sông nước trong thời đại biến đổi khí hậu.
Vùng ĐBSCL - trung tâm kinh tế, nông nghiệp quan trọng của cả nước đang đối mặt áp lực ngày càng lớn từ biến đổi khí hậu xâm nhập mặn sâu, sụt lún, sạt lở, suy giảm lưu lượng từ thượng nguồn sông Mê Công. Trong bối cảnh đó, khoa học và công nghệ được xác định là trụ cột để vùng chuyển hướng sang mô hình phát triển bền vững và dài hạn.
Đồng bằng sông Cửu Long đẩy nhanh tiến độ xây dựng nhà ở xã hội 
Đồng bằng sông Cửu Long sẽ phát triển hơn khi các dự án hạ tầng chiến lược sớm hoàn thành 
