Theo dự thảo tờ trình, Bộ Nội vụ cho biết, để các cơ quan chuyên môn cấp tỉnh thực hiện có hiệu quả chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn được giao trong điều kiện quy mô và phạm vi quản lý được mở rộng thì cần thiết phải sửa đổi quy định số lượng cấp phó của sở, của phòng chuyên môn thuộc sở và tiêu chí biên chế tối thiểu khi thành lập phòng cho phù hợp.
Các tỉnh tổ chức không quá 14 sở
Theo đó, đối với cơ quan chuyên môn thuộc UBND cấp tỉnh, dự thảo nghị định đề xuất quy định về tiêu chí xác định số lượng cấp phó của phòng chuyên môn và tiêu chí biên chế tối thiểu khi thành lập phòng chuyên môn thuộc sở như quy định đối với phòng thuộc sở tại TP Hà Nội và TP Hồ Chí Minh. Các tỉnh, thành phố được tổ chức không quá 14 sở, riêng TP Hà Nội và TP Hồ Chí Minh có không quá 15 sở. Trong đó, các sở được tổ chức thống nhất ở địa phương gồm: Sở Nội vụ, Tư pháp, Tài chính, Công Thương, Nông nghiệp và Môi trường, Xây dựng, Khoa học và Công nghệ, Văn hóa - Thể thao và Du lịch, Giáo dục và Đào tạo, Y tế, Thanh tra tỉnh, Văn phòng UBND. Các sở đặc thù được tổ chức ở một số địa phương gồm Sở Ngoại vụ, Dân tộc và Tôn giáo, Du lịch, Sở Quy hoạch - Kiến trúc được thành lập ở TP Hà Nội và TP Hồ Chí Minh. Như vậy, quy định về nội dung này tại dự thảo vẫn giữ nguyên như hiện hành.
Cơ cấu tổ chức của sở gồm: Phòng chuyên môn, nghiệp vụ; văn phòng (nếu có); chi cục và tổ chức tương đương (nếu có); đơn vị sự nghiệp công lập (nếu có).
TPHCM tăng thêm không quá 15 phó giám đốc Sở
Theo dự thảo Nghị định, số lượng phó trưởng phòng chuyên môn, nghiệp vụ thuộc sở được quy định như sau: Phòng thuộc sở có dưới 10 biên chế công chức được bố trí 1 phó trưởng phòng; phòng thuộc sở có từ 10 đến 14 biên chế công chức được bố trí không quá 2 phó trưởng phòng. Bên cạnh đó, phòng thuộc sở có từ 15 biên chế công chức trở lên được bố trí không quá 3 phó trưởng phòng. Về tiêu chí biên chế tối thiểu khi thành lập phòng chuyên môn, nghiệp vụ thuộc sở, khối lượng công việc yêu cầu phải bố trí tối thiểu 7 biên chế công chức.
Dự thảo Nghị định cũng đề xuất quy định bình quân mỗi sở bố trí 4 phó giám đốc, tăng 1 phó giám đốc so với quy định hiện hành. Riêng TP Hà Nội và TPHCM, ngoài tổng số lượng phó giám đốc sở theo quy định tính bình quân chung thì Hà Nội được tăng thêm không quá 10 phó giám đốc và TPHCM được tăng thêm không quá 15 phó giám đốc.
Bố trí đủ kinh phí thực hiện sắp xếp tinh gọn bộ máy 
Đề xuất mới về số lượng cấp phó phù hợp với sắp xếp, tinh gọn bộ máy 
