Theo Thanh tra Chính phủ, bắt đầu từ 6/8, tổ công tác của cơ quan này tiến hành thanh tra, làm rõ trách nhiệm đối với Chủ tịch UBND TP Hồ Chí Minh trong việc thực hiện pháp luật về thanh tra, giải quyết khiếu nại, tố cáo (KNTC) và phòng, chống tham nhũng (PCTN). Đoàn thanh tra gồm 9 thành viên, do Cục trưởng Cục III Võ Văn Đồng làm Trưởng đoàn; thời hạn thanh tra là 70 ngày làm việc thực tế tại đơn vị kể từ ngày công bố quyết định thanh tra; thời kỳ thanh tra tính từ ngày 1/1/2011 đến ngày 31/5/2014. Theo Quyết định 1762/QĐ-TTCP của Thanh tra Chính phủ, giao Trưởng phòng Nghiệp vụ 3, Vụ Giám sát, thẩm định và xử lý sau thanh tra Ngô Khánh Luận, làm Tổ trưởng Tổ Giám sát.
Đoàn thanh tra có nhiệm vụ thanh tra trách nhiệm của Chủ tịch Chủ tịch UBND TP Hồ Chí Minh và thủ trưởng một số cơ quan hành chính nhà nước trên địa bàn trong việc thực hiện pháp luật về thanh tra, giải quyết KNTC và PCTN; nhiệm vụ, quyền hạn của Trưởng Đoàn thanh tra, thành viên Đoàn thanh tra được thực hiện theo quy định của Luật Thanh tra; Luật KN; Luật TC; Luật PCTN; Quy chế hoạt động của đoàn thanh tra và các quy định khác của pháp luật có liên quan.
Về công tác PCTN tập trung vào 02 vấn đề lớn: Việc tuyên truyền pháp luật về PCTN, việc kê khai tài sản theo Nghị định 78/CP của Chính phủ. Đoàn thanh tra thực hiện đúng pháp luật thanh tra, quy chế của Đoàn thanh tra và có báo cáo đúng tiến độ thanh tra cho lãnh đạo Thanh tra Chính phủ, phải tiếp cận hồ sơ, kiểm tra xác minh thực tế… phải có lịch làm việc cụ thể. Đối với Tổ Giám sát, bám sát kế hoạch của Đoàn thanh tra để thực hiện giám sát và có báo cáo lãnh đạo Thanh tra Chính phủ; tham gia thẩm định các văn bản của Đoàn thanh tra theo quy định.
Theo Chủ tịch Chủ tịch UBND TP Hồ Chí Minh Lê Hoàng Quân, thành phố đã có văn bản chỉ đạo các quận, huyện, sở ngành, giao Thanh tra thành phố là đầu mối bố trí nơi làm việc và cung cấp hồ sơ, kết nối các quận, huyện giúp Đoàn thanh tra trong quá trình thanh tra
