Sau khi bị Hội đồng xét xử sơ thẩm tuyên án tử hình, về tội tham ô tài sản, bị cáo Dương Chí Dũng đã kháng cáo theo hướng kêu oan; đối với tội cố ý làm trái quy định của nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng, bị tuyên phạt 18 năm tù và buộc bồi thường 110 tỷ đồng, bị cáo Dũng kháng cáo đề nghị xem xét lại mức độ trách nhiệm của bị cáo trong vụ án.
Bị cáo Mai Văn Phúc, nguyên Tổng Giám đốc Vinalines bị tuyên án tử hình về tội tham ô tài sản và 18 năm tù về tội cố ý làm trái quy định của nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng cũng đã làm đơn kháng cáo tương tự nội dung kháng cáo của bị cáo Dương Chí Dũng.
Theo luật định, các bị cáo có quyền kháng án trong thời hạn 15 ngày làm việc kể từ khi Hội đồng xét xử sơ thẩm tuyên án. Bản án của TAND Hà Nội được tuyên chiều 16/12/2013.
Trước đó, Tòa án cấp sơ thẩm cũng đã nhận được tám đơn kháng cáo của các bị cáo trong vụ án xảy ra tại Tổng Công ty Hàng hải Việt Nam