Cục B56 được thành lập từ năm 2005, trên cơ sở chia tách một đơn vị có bề dày truyền thống Anh hùng lực lượng vũ trang nhân dân thuộc Tổng cục V. Trải qua 10 năm xây dựng và trưởng thành, cán bộ, chiến sỹ Cục đã lập nhiều chiến công xuất sắc. Do tính chất đặc thù công việc, có khi hoạt động ở địa bàn xa đơn vị, đơn tuyến, gặp nhiều khó khăn, thử thách, thậm chí hiểm nguy... nhưng từ lãnh đạo Cục đến mỗi cán bộ, chiến sỹ đều đoàn kết, nỗ lực hoàn thành xuất sắc nhiệm vụ được giao.
Trên cơ sở chức năng, nhiệm vụ được giao, thời gian qua, Cục B56 đã luôn bám sát các Chỉ thị, Nghị quyết của Đảng, yêu cầu thường xuyên, đột xuất của lãnh đạo các cấp để chủ động nắm tình hình, cụ thể hóa thành các chương trình, kế hoạch công tác và tổ chức triển khai đúng định hướng, có trọng tâm, trọng điểm từ Trung ương đến địa phương, từ trong nước ra nước ngoài. Cục B56 đã thực hiện nghiêm túc khẩu hiệu hành động của Bộ Công an năm 2014 “Chủ động, kỷ cương, trách nhiệm, hiệu quả”, trong đó, chú trọng nâng cao hiệu quả công tác trong tình hình mới, nắm chắc tình hình để góp phần đánh giá, phân tích, dự báo sát, tham mưu có hiệu quả với việc hoạch định và thực hiện chính sách đối nội, đối ngoại của Đảng, Nhà nước.
Ngoài ra, Cục còn có những mặt công tác nổi bật như: Góp phần thúc đẩy hội nhập, nâng cao vai trò, vị thế của Việt Nam trên trường quốc tế, cùng cả nước đấu tranh bảo vệ chủ quyền biển, đảo thiêng liêng của Tổ quốc. Vô hiệu hóa âm mưu, hoạt động chống phá của các thế lực thù địch và góp phần đảm bảo an ninh kinh tế, an ninh năng lượng, an ninh lương thực và phục vụ các đề án lớn của Chính phủ… Công tác xây dựng Đảng, xây dựng lực lượng luôn được đặt lên hàng đầu, Đảng bộ liên tục đạt trong sạch, vững mạnh và nhiều năm đạt tiêu biểu.
Bằng sự nỗ lực của toàn thể cán bộ, chiến sỹ trong đơn vị, với những chiến công, thành tích đạt được, góp phần giữ vững an ninh quốc gia, tích cực góp phần phát triển kinh tế, xã hội và đối ngoại của đất nước; trong 10 năm qua, nhiều tập thể, cá nhân Cục B56 đã được Đảng, Nhà nước, Bộ Công an tặng thưởng các phần thưởng cao quý như: Cục B56 được tặng thưởng Huân chương Bảo vệ Tổ quốc hạng Ba; Huân chương Chiến công hạng Ba; 4 lần được nhận Cờ thi đua của Chính phủ; 5 lần nhận Cờ thi đua của Bộ Công an…
