Nhiều vấn đề của dự luật cũng còn ý kiến khác nhau như cơ chế thu hồi đất; thẩm quyền về giao đất, cho thuê đất, cho phép chuyển mục đích sử dụng đất; nguyên tắc định giá đất và việc giải quyết tranh chấp đất đai. Liên quan đến quy định về quyền của Nhà nước được ưu tiên nhận chuyển nhượng quyền sử dụng đất, mua tài sản gắn liền với đất, Thường trực Ủy ban Kinh tế cho rằng không nên quy định quyền này vì hiện nay đã có quy định Nhà nước có thể sử dụng quyền thu hồi đất vào mục đích quốc phòng, an ninh và lợi ích quốc gia.
Tuy nhiên, Chủ tịch Hội đồng Dân tộc Ksor Phước đề nghị cần có quy định này để Nhà nước có thể chủ động tạo quỹ đất “sạch” sử dụng vào mục đích phát triển kinh tế, xã hội. Ông cho rằng, xuất phát từ những vấn đề lợi ích của quốc gia chứ không chỉ vấn đề quốc phòng-an ninh thì Nhà nước cũng có quyền thu hồi đất vì đây là sở hữu toàn dân. “Ví dụ như một xã, phường thiếu trường học thì phải giải quyết trường học, thiếu trạm xá thì phải giải quyết trạm xá. Về nguyên tắc, Nhà nước phải có quyền quy hoạch đất đai và được thu hồi và sử dụng vào vấn đề quốc phòng an ninh và vấn đề chung của cộng đồng” - ông Ksor Phước lập luận.
Nhiều ý kiến cũng thừa nhận, nhiều điều khoản của dự luật quy định còn chung chung, chưa chặt chẽ, gây khó khăn khi triển khai thực hiện. Theo Bộ trưởng Tài nguyên Môi trường Nguyễn Minh Quang, nếu nâng Luật Đất đai thành bộ luật thì cần thêm thời gian, còn nếu đến kỳ họp năm sau thông qua (tháng 6/2013) thì khá gấp gáp. Với dự luật sửa đổi, dự kiến sẽ có 5 nghị định hướng dẫn tập trung vào các vấn đề cụ thể. Thường vụ Quốc hội thống nhất tổ chức lấy ý kiến nhân dân về dự thảo Luật Đất đai (sửa đổi) trong hai tháng, từ khoảng tháng 2 đến 4/2013. Việc lấy ý kiến được tổ chức với các hình thức thích hợp, tạo điều kiện để các tổ chức, cá nhân góp ý. Ý kiến đóng góp của người dân sẽ được tập hợp, tổng hợp và tiếp thu, giải trình nghiêm túc.
Chiều 14/12, UBTV Quốc hội đã họp phiên bế mạc. UBTV Quốc hội cũng đã cho ý kiến và thông qua Nghị quyết về việc thực hiện thu, chi tiền lãi dầu khí nước chủ nhà được chia từ Xí nghiệp lên doanh Vietsovpetro và các hợp đồng phân chia sản phẩm dầu khí