Trong quý II, Thủ tướng Chính phủ đã có ý kiến đối với 6 kết luận thanh tra do Thanh tra Chính phủ báo cáo, gồm: việc chấp hành chính sách, pháp luật trong công tác quản lý và sử dụng vốn, tài sản của Tập đoàn Hóa chất; việc chấp hành chính sách, pháp luật tại Tập đoàn Viễn thông Quân đội; việc chấp hành pháp luật trong quản lý vốn, tài sản tại Tổng Công ty Hàng hải Việt Nam; việc chấp hành pháp luật trong công tác quy hoạch quản lý và sử dụng đất tại Kiên Giang; công tác quản lý đầu tư xây dựng khu công nghiệp, khu đô thị tại Vĩnh Phúc; chấp hành pháp luật, giải quyết khiếu nại, tố cáo và phòng, chống tham nhũng tại Bến Tre. Thanh tra Chính phủ đã kiến nghị thu hồi về ngân sách nhà nước 1.503 tỷ đồng và 48ha đất; kiến nghị các cơ quan có thẩm quyền xem xét và xử lý 1.978 tỷ đồng; kiến nghị tổ chức kiểm điểm trách nhiệm đối với tập thể và cá nhân có vi phạm.
Sáu tháng đầu năm 2012, Thanh tra các bộ, ngành và địa phương triển khai 6.029 cuộc thanh tra, đã kết thúc và ban hành kết luận 1.933 cuộc, phát hiện vi phạm về kinh tế 2.981 tỷ đồng, 1.407ha đất, kiến nghị thu hồi về cho Nhà nước 2.026 tỷ đồng, 1.243ha đất; kiến nghị các cấp có thẩm quyền xem xét và xử lý 956 tỷ đồng; kiến nghị xử lý hành chính 425 tập thể, 697 cá nhân; chuyển cơ quan điều tra 22 vụ bằng 35 người.
Lực lượng Thanh tra chuyên ngành đã tiến hành thanh tra, kiểm tra việc chấp hành pháp luật trên các lĩnh vực quản lý nhà nước như: chấp hành các quy định về kinh doanh, vận tải hành khách bằng ôtô; việc thực hiện giấy phép xây dựng; chất lượng xăng dầu, hoạt động tổ chức biểu diễn, an toàn vệ sinh thực phẩm... và đã phát hiện 168.267 tổ chức, cá nhân vi phạm; kiến nghị thu hồi 132 tỷ đồng, ban hành quyết định xử phạt vi phạm hành chính 158 tỷ đồng.
Trong quý II, Thanh tra Chính phủ đã tích cực xây dựng Luật Tiếp công dân; Luật Phòng, chống tham nhũng (sửa đổi); Nghị định về trách nhiệm giải trình của cán bộ, công chức, người đứng đầu cơ quan, tổ chức, đơn vị trong việc thực hiện nhiệm vụ, công vụ...