Theo điều tra ban đầu, ông Mẫn đã lập khống báo cáo tài chính, xác nhận sai về tài sản thế chấp, nâng khống số lượng hàng tồn kho dưới thời điều hành của ông Lâm Ngọc Khuân, Chủ tịch HĐQT (hiện đang ở Hoa Kỳ).
Cũng liên quan đến vụ án, cùng ngày, cơ quan CSĐT Bộ Công an triển khai quyết định khởi tố bị can đối với hai ông là Nguyễn Thế Thắng, Giám đốc và Nguyễn Văn Xem, Phó Giám đốc Ngân hàng Phát triển Việt Nam (VDB), Chi nhánh Sóc Trăng về hành vi như trên.
Cũng trong ngày, cơ quan CSĐT Bộ Công an công bố quyết định khởi tố bị can, lệnh bắt tạm giam ông Đỗ Hùng Sở, Giám đốc Ngân hàng Bưu điện Liên Việt (TP Vị Thanh, Hậu Giang) về hành vi trên.
Theo một lãnh đạo Công ty Phương Nam, ông Lâm Minh Mẫn và 3 lãnh đạo ngân hàng vừa bị bắt liên quan đến nợ nần của Công ty Phương Nam dưới thời điều hành của ông Lâm Ngọc Khuân - cựu Chủ tịch HĐQT. Gần 2 năm trước khi công ty lún vào nợ nần, ông Khuân cùng gia đình bay sang Hoa Kỳ, bỏ lại khoản nợ 1.600 tỷ đồng.
Giữa năm 2012, ông Khuân gửi thư cáo bệnh từ Hoa Kỳ để không về Việt Nam nên 7 ngân hàng chủ nợ ngồi lại với nhau tìm cách tái cơ cấu doanh nghiệp bên bờ vực phá sản. Để vay được số tiền lớn, Công ty Phương Nam đã thế chấp rất nhiều đất đai, nhà xưởng, hàng tồn kho, xe tải của nhà máy chế biến thủy sản tại TP Sóc Trăng và nhiều căn nhà của ông Khuân sở hữu tại TP Hồ Chí Minh.
Qua điều tra, Cơ quan Công an xác định hàng tồn kho trên sổ sách trị giá trên 700 tỷ đồng, nhưng thực tế hàng trong kho chỉ hơn 20 tỷ đồng. Đây chính là nguyên nhân xác định ông Mẫn đã ký biên bản kiểm tra hàng hóa lưu kho nâng khống số lượng để giúp doanh nghiệp vay rất nhiều tiền của ngân hàng
