Tại cửa khẩu quốc tế Kim Thành (Lào Cai) hiện có khoảng 300 xe nông sản tươi sống (rau, củ quả) và hàng bánh kẹo chưa có kết quả kiểm tra an toàn thực phẩm (ATTP) để được thông quan hàng hóa.
Tại cửa khẩu Hoa Lư (Đồng Nai) có 251 xe chở mặt hàng sắn lát chuối chưa có kết quả kiểm tra ATTP.
Tại một số cửa khẩu khác, số lượng hàng hóa là thực phẩm bị ùn tắc như sau: Lao Bảo (Quảng Trị) 50 xe, Dinh Bà (Đồng Tháp) 100 xe, Vĩnh Xương (An Giang) 200 ghe thuyền, Thường Phước (Đồng Tháp) 200 ghe thuyền, Tịnh Biên 200 xe,…
Theo Cục Hải quan, việc chưa thực hiện thông quan được các hàng hóa nêu trên do các đơn vị thực hiện kiểm tra nhà nước về ATTP theo quy định tại Nghị định số 46/2026/NĐ-CP tạm ngưng cấp giấy chứng nhận kiểm dịch và kiểm tra ATTP cho các lô hàng thực phẩm nhập khẩu có nguồn gốc từ thực vật và động vật.
Mặc dù Nghị định số 46/2026/NĐ-CP và Nghị quyết số 66.13/2026/NQ-CP có quy định chuyển tiếp đối với việc tự công bố và đăng ký bản công bố sản phẩm, cơ quan kiểm tra nhà nước đối với thực phẩm nhập khẩu, tuy nhiên không có điều khoản chuyển tiếp đối với trình tự kiểm tra nhà nước về ATTP đối với thực phẩm nhập khẩu để làm cơ sở ban hành Thông báo kết quả xác nhận thực phẩm đạt yêu cầu nhập khẩu.
Hàng hóa là thực phẩm nhập khẩu qua các cửa khẩu, đặc biệt là các cửa khẩu biên giới chủ yếu là hàng nông sản, hoa quả tươi sống, dễ hư hỏng hoặc bánh kẹo, thực phẩm có hạn sử dụng ngắn ngày nếu không được thông quan ngay trong ngày sẽ gây thiệt hại rất lớn cho doanh nghiệp, kéo theo các chi phí lưu công, lưu bãi, phạt do đình trệ giao hàng,… sẽ gây khó khăn và thiệt hại cho doanh nghiệp. Mặt khác, nguy cơ gây ách tắc tại cửa khẩu do không giải phóng hàng hóa, phương tiện cũng tiềm ẩn các nguy cơ gây mất an toàn, an ninh khu vực biên giới đặc biệt là trong đợt cao điểm tết nguyên đán sắp đến.
Do vậy, để kịp thời tháo gỡ vướng mắc, ngày 31/1/2026, Cục Hải quan đã có Công văn hỏa tốc số 8012/CHQ-GSQL kiến nghị Bộ Y tế, Bộ Công Thương, Bộ Nông nghiệp và Môi trường (với vai trò là cơ quan quản lý ATTP theo lĩnh vực được giao) sớm có hướng dẫn để tháo gỡ vướng mắc, khó khăn trên, hạn chế thiệt hại cho doanh nghiệp, tránh ách tắc hàng hóa gây mất an toàn an ninh tại cửa khẩu. Đồng thời, Cục Hải quan đã chỉ đạo các Chi cục Hải quan khu vực tăng cường ứng trực, kịp thời thực hiện thủ tục thông quan ngay khi các bộ chuyên ngành có biện pháp tháo gỡ các vướng mắc nêu trên.
Liên quan đến những nội dung vướng mắc khi triển khai Nghị định số 46/2026/NĐ-CP, Hiệp hội Sữa cũng đã có Công văn gửi Phó Thủ tướng kiến nghị để sớm có hướng dẫn cho thông quan các lô hàng.
Châu Âu chật vật vì xuất nhập khẩu ách tắc 
Kêu gọi các hãng tàu chung tay “giải cứu” ách tắc nông sản 
