Như Báo CAND đã thông tin, bị can Nguyễn Văn Hậu bị Cơ quan CSĐT Bộ Công an đề nghị truy tố về 3 tội: “Vi phạm quy định về kế toán gây hậu quả nghiêm trọng”, “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng” và “Đưa hối lộ”.
Ở tội “Đưa hối lộ”, cơ quan điều tra xác định, Hậu đã đưa hối lộ nhiều cán bộ lãnh đạo một số tỉnh như: Vĩnh Phúc, Phú Thọ, Quảng Ngãi tổng số tiền hơn 132 tỷ đồng.
Ở tội “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”, cơ quan điều tra xác định thiệt hại là 495 tỷ đồng.
Ở tội “Vi phạm quy định về kế toán gây hậu quả nghiêm trọng”, cơ quan điều tra xác định, Hậu gây thiệt hại tài sản Nhà nước tổng số 504 tỷ đồng tiền thuế. Theo kết luận điều tra, Hậu thành lập Công ty cổ phần Tập đoàn Phúc Sơn từ năm 2004. Để phục vụ hoạt động kinh doanh, ngoài doanh nghiệp này, Hậu còn thành lập, điều hành một số công ty khác trong đó có Công ty Thăng Long để hình thành hệ sinh thái Phúc Sơn.
Trong thời gian từ năm 2011 đến năm 2022, Hậu chỉ đạo chị gái Nguyễn Thị Hằng (Phó Tổng Giám đốc Công ty cổ phần Tập đoàn Phúc Sơn) và các nhân viên cấp dưới trực tiếp bán hoặc thông qua Công ty Nam Á (do bị can Trần Hữu Định làm Giám đốc) chuyển nhượng quyền sử dụng đất tại 4 dự án tại tỉnh Vĩnh Phúc gồm: Dự án Chợ đầu mối, Dự án Khu đô thị mới Tứ Trưng, Dự án Khu trung tâm thương mại và nhà ở Phúc Sơn giai đoạn 1 và Dự án Khu trung tâm thương mại và nhà ở Phúc Sơn giai đoạn 2.
Quá trình chuyển nhượng, các bị can đã khai man, sử dụng hai hệ thống sổ sách kế toán, tài chính. Trong đó, một hệ thống để theo dõi các khoản tiền thu theo hợp đồng để hạch toán, kê khai, báo cáo thuế, thực hiện nghĩa tài chính. Một hệ thống sổ sách khác để theo dõi riêng các khoản tiền thu ngoài hợp đồng của khách hàng, không ghi nhận trên sổ sách, không kê khai, hạch toán để nhằm che giấu, trốn tránh nghĩa vụ tài chính.
Kết quả điều tra vụ án xác định, Công ty cổ phần Tập đoàn Phúc Sơn và Công ty Thăng Long bán tổng cộng 1.317 lô đất tại 4 dự án bất động sản cho 799 khách hàng, thu tổng số tiền 3.540 tỷ đồng. Trong đó, chỉ có 1.465 tỷ đồng thu theo hợp đồng để hạch toán, kê khai, báo cáo thuế. Hơn 2.072 tỷ đồng không kê khai, hạch toán sổ sách.
Ngoài việc chỉ đạo các đối tượng nêu trên thực hiện hành vi bán các lô đất để ngoài sổ sách, Hậu còn thay mặt Công ty cổ phần Tập đoàn Phúc Sơn, Công ty Thăng Long trực tiếp ký tổng cộng 314 hợp đồng các loại, 859 phiếu thu và 463 hóa đơn GTGT để bán 1.317 lô đất trên.
Kết quả giám định tư pháp xác định, việc bán 1.317 lô đất tại 4 dự án nêu trên, Công ty cổ phần Tập đoàn Phúc Sơn và Công ty Thăng Long đã thu số tiền 2.072 tỷ đồng để ngoài sổ sách, không khai báo, hạch toán thuế gây thiệt hại tài sản Nhà nước tổng số 504 tỷ đồng thuế thu nhập doanh nghiệp và GTGT.
Quá trình điều tra, Hậu khai nhận hành vi phạm tội như trên. Theo đó, Hậu giao Ban kinh doanh khảo sát giá đất, xây dựng bảng kê chuyển cho Hậu để thống nhất với Đỗ Thị Mai (Trưởng ban Tài chính - Kế toán) lập phương án giá trong hợp đồng, giá ngoài hợp đồng đối với từng lô đất.
Sau khi bán hàng, tiền trong hợp đồng thì nhập quỹ công ty để hạch toán, kê khai, báo cáo thuế. Tiền ngoài hợp đồng thì theo dõi riêng, chuyển cho Hậu sử dụng.
Đối với Công ty Nam Á, bị can Trần Hữu Định khai, do quen biết từ trước với Nguyễn Văn Hậu nên được Phúc Sơn hợp tác bán các lô đất tại 4 dự án trên. Công ty Nam Á có sàn giao dịch bất động sản mở tại xã Tam Phúc, huyện Vĩnh Tường (tỉnh Vĩnh Phúc) và thỏa thuận với khách mua đất về tiền trong, tiền ngoài. Công ty Nam Á đã bán 345 lô đất, thu 1.417 tỷ đồng rồi chuyển lại cho Công ty cổ phần Tập đoàn Phúc Sơn. Ở chiều ngược lại, Định được nhận tiền hoa hồng là 5 tỷ đồng.
Sớm kết thúc điều tra các vụ án liên quan đến Tập đoàn Phúc Sơn, Thuận An 
Vụ án Tập đoàn Phúc Sơn: Thu giữ 300 tỷ đồng, 500 lượng vàng, 1.000 sổ đỏ 
