Để bảo đảm an toàn chạy tàu và phù hợp với điều kiện thực tế, đường sắt tạm ngừng chạy đôi tàu SE6/SE5 xuất phát tại ga Sài Gòn và ga Hà Nội từ ngày 2/12 đến hết ngày 10/12/2025.
Đồng thời, tạm ngừng chạy đôi tàu SE22/SE21 xuất phát tại ga Sài Gòn và ga Đà Nẵng vào các ngày 2, 3, 4, 8, 9 và 10/12/2025. Hành khách có vé trên các chuyến tàu bị ảnh hưởng có thể thực hiện trả vé online trên website vé tàu điện tử của đường sắt hoặc trả vé trực tiếp tại nhà ga, không mất phí.
Lãnh đạo Công ty CP Vận tải đường sắt thông tin thêm, đợt mưa lũ lịch sử khu vực Nam Trung Bộ đã làm hư hỏng hạ tầng đường sắt kéo dài từ Diêu Trì đến Nha Trang, gây ách tắc vận tải từ 17-25/11/2025. Sau khi thông đường, vẫn hạn chế lưu lượng tàu chạy qua các điểm xung yếu để tiếp tục sửa chữa, gia cố nền đường, dần khôi phục vận tốc chạy tàu về bình thường, vì vậy đường sắt phải điều chỉnh lịch chạy tàu.
Ảnh hưởng, đường sắt phải ngừng chạy tàu, tính đến 2/12, đã thông báo ngừng chạy hơn 100 đoàn tàu khách trong giai đoạn 17/11 - 10/12/2025 và 65 đoàn tàu hàng. Cùng đó, phục vụ ăn uống miễn phí cho hành khách trên các đoàn tàu bị ảnh hưởng chờ dọc đường: hơn 35.000 suất ăn, gồm cả suất chính và phụ. Số lượng vé tàu đã trả lại cho hành khách là 39.000 vé, tương đương số tiền gần 24 tỷ đồng. Ước tính thiệt hại tàu khách và hàng gần 50 tỷ đồng.
Loại bỏ “điểm đen” giao thông đường sắt tại Đà Nẵng 
Ngày 24/11, còn 15 vị trí tắc đường trên các quốc lộ, đường sắt cũng chưa thể thông toàn tuyến 
