Theo kết luận của Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy Phú Yên sau một cuộc kiểm tra dấu hiệu vi phạm của đảng viên, với tư cách là chủ đầu dự án ứng dụng công nghệ thông tin trong hoạt động cơ quan quản lý nhà nước ở Phú Yên trong hai năm 2012-2013, ông Lê Thanh Phương - Giám đốc Sở TT-TT Phú Yên ký kết hợp đồng với Công ty cổ phần Tin học giải pháp tích hợp mở (iNet) ở phường 3, quận Phú Nhuận, TP Hồ Chí Minh thực hiện kế hoạch đào tạo tin học cho cán bộ, công chức, viên chức trong tỉnh Phú Yên, chuyển giao công nghệ phần mềm quản lý văn bản cho Trung tâm tích hợp dữ liệu và Trung tâm công nghệ thông tin Phú Yên.
Quá trình thực hiện hợp đồng, ông Lê Thanh Phương không thực hiện đúng Quyết định 2108/QĐ-UBND ngày 2/12/2013 của UBND tỉnh Phú Yên về điều chỉnh đề cương và dự toán chi tiết ứng dụng công nghệ thông tin trong hoạt động cơ quan nhà nước, cố ý làm trái nguyên tắc tài chính gây thất thoát hơn 1,1 tỷ đồng, gây lãng phí tài sản nhà nước hơn 320 triệu đồng. Trong số đó có trường hợp thông đồng với đối tác “rút ruột” công quỹ nhà nước 268 triệu đồng; chỉ đạo cán bộ, nhân viên tạo dựng một số chứng từ khống, hợp thức hóa chứng từ để thanh toán trái với thực tế gần 241 triệu đồng, trong đó có hơn 142 triệu đồng đã bị một số cán bộ, nhân viên chiếm đoạt để chia nhau.
Ngoài ra, khi thực hiện các chương trình đào tạo kỹ năng ứng dụng và khai thác phần mềm quản lý văn bản, email; nâng cấp, hiệu chỉnh và cập nhật trang dịch vụ công cấp độ 3 cấp phép báo chí xuất bản; cài đặt phần mềm quản lý Internet…, ông Lê Thanh Phương đã có hành vi thiếu trách nhiệm, buông lỏng công tác quản lý tài chính, để cho cán bộ Trung tâm tích hợp dữ liệu Phú Yên tự ý xác lập và nâng khống thanh toán để chiếm đoạt hơn 620 triệu đồng. Do những sai phạm nêu trên, Ban Thường vụ Tỉnh ủy Phú Yên đã thống nhất thi hành kỷ luật bằng hình thức khai trừ ra khỏi đảng, kiến nghị cơ quan có thẩm quyền cách chức Giám đốc Sở TT-TT Phú Yên và buộc thôi việc đối với ông Lê Thanh Phương.
Liên quan đến sai phạm nêu trên, trước đó Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy Phú Yên cũng đã quyết định thi hành kỷ luật bằng hình thức khai trừ ra khỏi đảng đối với các ông bà Lê Tiến Dĩnh – Giám đốc Trung tâm tích hợp dữ liệu thuộc Sở TT-TT Phú Yên, kế toán trưởng Nguyễn Thị Hiếu, Trưởng phòng Quản lý công nghệ thông tin, Sở TT-TT Phú Yên Đoàn Hùng Thắng vì đã có hành vi cố ý làm trái nguyên tắc quản lý tài chính, cùng kế toán Trung tâm lập khống, nâng khống chứng từ của các gói thầu, gây thất thoát và chiếm đoạt hơn 869 triệu đồng. Hồ sơ vụ việc này đã được chuyển đến Công an tỉnh Phú Yên điều tra xử lý.
Được biết, ông Lê Thanh Phương sinh năm 1965, trú ở 54B Nguyễn Thái Học, phường 5, TP Tuy Hòa, có trình độ chuyên môn thạc sĩ công nghệ thông tin, kỹ sư cơ khí. Trước khi đảm nhiệm chức vụ Giám đốc Sở TT-TT Phú Yên từ đầu năm 2012, ông Phương từng làm Phó Chủ tịch UBND TP Tuy Hòa; Tỉnh ủy viên - Phó Giám đốc Sở Khoa học - Công nghệ Phú Yên. Liên quan đến sai phạm nêu trên, Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy Phú Yên cũng đã đề nghị Đảng ủy khối các cơ quan tỉnh Phú Yên chỉ đạo kiểm điểm, xử lý một số đảng viên, công chức khác.
