Theo quy định cơ sở khám, chữa bệnh nhân đạo để được cấp giấy phép hoạt động phải đáp ứng đủ điều kiện về quy mô, cơ sở vật chất, tổ chức nhân sự, trang thiết bị y tế tương ứng với hình thức tổ chức quy định. Biển hiệu của cơ sở phải ghi rõ là cơ sở khám bệnh, chữa bệnh nhân đạo. Có văn bản chứng minh có nguồn tài chính ổn định bảo đảm cho hoạt động khám chữa bệnh nhân đạo. Các đoàn khám chữa bệnh nhân đạo trong nước khi thực hiện khám bệnh, chữa bệnh tại cơ sở khám bệnh, chữa bệnh thì cơ sở này phải có giấy phép theo quy định của Luật Khám bệnh, chữa bệnh.
Khi thực hiện việc khám, chữa bệnh tại các địa điểm khác thì cần phải đáp ứng các điều kiện về cơ sở vật chất theo quy định của Bộ Y tế. Người chịu trách nhiệm chuyên môn kỹ thuật của đoàn khám bệnh, chữa bệnh nhân đạo phải là bác sĩ có chứng chỉ hành nghề khám bệnh, chữa bệnh theo quy định, phù hợp với danh mục đăng ký, đã có thời gian hành nghề ít nhất 36 tháng; là lương y hoặc người có bài thuốc gia truyền hoặc người có phương pháp chữa bệnh gia truyền có chứng chỉ hành nghề theo quy định nếu khám, chữa bệnh nhân đạo bằng y học cổ truyền. Đối với các đoàn khám chữa bệnh nhân đạo nước ngoài, ngoài việc tuân thủ các quy định trên còn phải đáp ứng các điều kiện khác đối với người chịu trách nhiệm chuyên môn kỹ thuật, các thành viên khác của đoàn trực tiếp tham gia khám chữa bệnh…
Thẩm quyền cấp giấy phép hoặc cho phép hoạt động khám chữa bệnh nhân đạo: Bộ trưởng Bộ Y tế cho phép cá nhân, đoàn khám bệnh, chữa bệnh nhân đạo trong nước, nước ngoài tổ chức khám, chữa bệnh tại cơ sở khám, chữa bệnh trực thuộc Bộ Y tế; Lãnh đạo Bộ, ngành cho phép cá nhân, đoàn khám bệnh, chữa bệnh nhân đạo trong nước, nước ngoài tổ chức khám, chữa bệnh tại cơ sở khám, chữa bệnh thuộc quyền quản lý; Giám đốc Sở Y tế cho phép cá nhân, đoàn khám bệnh, chữa bệnh nhân đạo trong nước, nước ngoài, đội khám bệnh chữ thập đỏ lưu động tổ chức khám, chữa bệnh tại cơ sở khám, chữa bệnh thuộc Sở Y tế.
Thông tư có hiệu lực thi hành từ ngày 15/10/2014. Thông tư cũng quy định các tổ chức, cá nhân thực hiện khám bệnh, chữa bệnh nhân đạo chỉ được phép thực hiện khám, chữa bệnh nhân đạo sau khi có văn bản cho phép của cơ quan nhà nước có thẩm quyền; trong thời hạn 10 ngày làm việc kể từ ngày kết thúc đợt khám bệnh, chữa bệnh nhân đạo, tổ chức, cá nhân thực hiện phải gửi báo cáo kết quả hoạt động đến Bộ Y tế hoặc Sở Y tế hoặc Bộ, ngành cấp phép tổ chức hoạt động khám chữa bệnh nhân đạo này
