Theo cáo trạng, từ tháng 8/2007, Lý Chí Nguyên được Techcombank tuyển dụng vào làm chuyên viên ATM quản lý 35 máy ATM trên địa bàn quận Gò Vấp. Theo nhiệm vụ được giao, hằng ngày, Nguyên kiểm tra số lượng tiền tại các máy ATM và báo cáo cho phòng ngân quỹ để xuất tiền đưa vào máy. Nếu được duyệt chi, Nguyên sẽ nhận chìa khóa khay tiền, chìa khóa két sắt của máy ATM từ thủ kho, sau đó cùng các kiểm soát viên và các chuyên viên phát triển mạng nhận tiền từ thủ quỹ đưa về bàn chạy tiền để cùng kiểm đếm, phân loại mệnh giá, cho vào khay và dán niêm phong, khóa khay lại.
Khi có lệnh đưa tiền ra các trụ ATM, Nguyên cùng chuyên viên phát triển mạng chuyển các khay tiền ra xe ngân hàng đưa đi. Tại máy ATM, Nguyên trực tiếp mở khóa két sắt và rút các khay tiền cũ ra và thay vào khay tiền mới, sau đó khóa két sắt lại.
Sau một thời gian làm việc, Nguyên nảy sinh ý định chiếm đoạt tiền của ngân hàng. Sau khi nhận tiền và sắp xếp vào khay dán niêm phong, trong thời gian chờ chuyển tiền, Nguyên nhanh chóng kéo khay tiền mệnh giá 500.000 đồng về phía gầm bàn làm việc, sau đó mở khóa lấy tiền bỏ vào thùng đựng giấy rồi đẩy khay về vị trí cũ. Nguyên đã chiếm đoạt số tiền 3,9 tỷ đồng. Quá trình điều tra, gia đình Nguyên đã khắc phục hậu quả được 200 triệu đồng
