Rất nhiều người sốc với thông tin Pep Guardiola sẽ trở thành HLV trưởng CLB Bayern Munich (Đức) vào mùa tới, chứ không phải những “gã nhà giàu” nước Anh như Chelsea hay Man City. Theo đánh giá của báo giới Tây Ban Nha thì ngay sau khi từ nhiệm HLV trưởng Barca, Guardiola đã được ban lãnh đạo Bayern liên tục tiếp xúc, và sau quá trình thương thảo Guardiola thực sự bị thuyết phục bởi một kế hoạch phát triển Bayern, đưa CLB này thống trị châu Âu mà đối tác của mình đã vạch ra.
Cũng theo báo chí Tây Ban Nha thì mùa hè mùa giải 2008 - 2009, khi lá thăm Champios League đưa Barca chạm trán Bayern thì Guardiola khi ấy đã thốt lên: “Ồ, hay đấy!”. Sau này thì Guardiola trả lời trong một cuộc phỏng vấn: “Tôi nói “ồ, hay đấy” không phải vì Bayern là một CLB dễ chơi, mà vì đấy là CLB tôi rất yêu thích. Được đối đầu với CLB yêu thích của mình chẳng phải là một cơ hội tuyệt vời đó sao?”. Guardiola nói thêm rằng ông luôn ấn tượng với tinh thần Đức và những lần dẫn Barca tới Đức thi đấu, ông luôn có những ấn tượng thực sự đặc biệt.
Theo HLV Schuster – người rất hiểu cả bóng đá Tây Ban Nha lẫn bóng đá Đức thì cựu HLV trưởng Barcelona với triết lý bóng đá tiqui – taca điển hình nhiều khả năng sẽ thổi một luồng gió mới vào Bayern. Nhưng Schuster không quên cảnh báo: “Tôi biết rõ là ở Bayern luôn có những nhà quản lý cứng rắn, và không ngại ngần can thiệp vào công việc của các HLV. Do đó Guardiola cũng phải lưu tâm đặc biệt tới vấn đề này”!