Tính đến nay, tại quần thể di tích lịch sử - văn hóa Phủ Dầy chỉ có thủ nhang phủ Vân Cát là được nhân dân bầu ra. Việc ban hành Quy chế quản lý, bảo vệ và phát huy giá trị quần thể Di tích lịch sử - văn hóa Phủ Dầy nhằm đổi mới việc quản lý theo hướng giao cho cộng đồng tham gia quản lý, tránh tình trạng tư nhân hóa, quản lý, bảo tồn và phát huy tốt hơn giá trị của di tích đồng thời khắc phục những tồn tại lâu nay. Đây cũng là bước đi tiến tới việc lập hồ sơ trình Thủ tướng Chính phủ xếp hạng quần thể di tích Phủ Dầy là Di tích cấp quốc gia đặc biệt.