Đối tượng thụ hưởng chương trình là học sinh đang được nuôi dưỡng, chăm sóc, giáo dục tại trường. Chương trình đề ra các chỉ tiêu chăm sóc, bảo vệ và quản lý sức khoẻ học sinh trong trường học như 80% trường học phải đảm bảo các điều kiện thực hiện công tác y tế trường học, chăm sóc sức khoẻ học sinh theo quy định; 75% trường học cung cấp đủ nước uống và nước sạch cho sinh hoạt; 80% trường học bố trí ít nhất 1 khu vực hoạt động đảm bảo trang thiết bị, dụng cụ cần thiết dành cho giáo dục thể chất và hoạt động thể thao.
Đặc biệt, về tổ chức đảm bảo bữa ăn học đường, bảo đảm dinh dưỡng trong trường học là vấn đề được xã hội hết sức quan tâm. Chương trình đề ra các mục tiêu cụ thể như 100% các trường học tổ chức bữa ăn học đường và căng tin phải đảm bảo các điều kiện về vệ sinh an toàn thực phẩm theo quy định; 60% trường có tổ chức bữa ăn học đường sử dụng sữa và các sản phẩm từ sữa trong bữa ăn học đường đạt chuẩn.
Tăng cường giám sát của xã hội đối với bữa ăn học đường 
