Để chủ động, kịp thời khắc phục hậu quả tai nạn giao thông và không để xảy ra các vụ tai nạn giao thông tương tự, Bộ GTVT yêu cầu: Cục Đường thủy nội địa Việt Nam, Sở GTVT Quảng Nam khẩn trương tổ chức phân tích để tìm ra nguyên nhân và làm rõ trách nhiệm các cá nhân, đơn vị liên quan để xảy ra vụ tai nạn nói trên; đồng thời chỉ đạo lực lượng Thanh tra giao thông đường thủy kiểm tra, rà soát toàn bộ các phương tiện chở khách, đặc biệt là phương tiện chở khách từ bờ ra đảo, bến tàu phục vụ du lịch, lễ hội; đình chỉ hoạt động của các phương tiện chở khách không đảm bảo tiêu chuẩn an toàn, vi phạm quy định về đăng ký, đăng kiểm, không trang bị đủ dụng cụ cứu sinh, chở quá số người quy định, người điều khiển phương tiện thủy không có bằng, chứng chỉ chuyên môn.
Báo cáo kết quả xử lý về Bộ GTVT trước ngày 15/3/2022. Phối hợp chặt chẽ với lực lượng Công an tỉnh Quảng Nam và các đơn vị có liên quan khẩn trương điều tra, xác minh nguyên nhân vụ tai nạn nói trên, xử lý nghiêm các tổ chức, cá nhân gây ra vụ tai nạn.
Bộ GTVT yêu cầu Cục Hàng hải Việt Nam chỉ đạo Trung tâm tìm kiếm, cứu nạn khẩn trương điều động tàu tham gia tìm kiếm, cứu nạn; các Cảng vụ hàng hải tiếp tục triển khai các giải pháp đảm bảo an toàn hàng hải, đặc biệt là các tuyến vận tải hành khách từ bờ ra đảo. Cục Đăng kiểm Việt Nam chỉ đạo các đơn vị đăng kiểm tăng cường kiểm tra chất lượng phương tiện, đặc biệt chú trọng tới các phương tiện thủy chở khách từ bờ ra đảo, phương tiện thủy phục vụ các lễ hội, tàu cao tốc.
Huy động phương tiện, nhân lực tìm kiếm, cứu người gặp nạn trên biển Cửa Đại 
Lật ca nô chở 39 du khách ở biển Cửa Đại, 14 người tử vong và mất tích 
