Các bị cáo bị đưa ra xét xử gồm: Dương Văn Hòa (cựu Hiệu trưởng Trường Đại học Đông Đô); Trần Kim Oanh (cựu Phó Hiệu trưởng, kiêm Phó Viện trưởng Viện Đào tạo liên tục Trường Đại học Đông Đô); Lê Ngọc Hà (cựu Phó Hiệu trưởng, kiêm Phó Viện trưởng Viện 4.0, Trưởng ban In bằng Trường Đại học Đông Đô); Trần Ngọc Quang (cựu Phó trưởng Phòng Đào tạo và quản lý sinh viên Trường Đại học Đông Đô); Nguyễn Thị Huệ (cựu Trưởng phòng Tài vụ Trường Đại học Đông Đô); Phạm Vân Thùy (cựu nhân viên Viện Đào tạo liên tục Trường Đại học Đông Đô); Nguyễn Thị Ngọc Thái (cựu nhân viên Viện Đào tạo liên tục Trường Đại học Đông Đô); Lê Thị Thanh Tâm (cựu nhân viên Viện 4.0 Trường Đại học Đông Đô); Lê Thị Lương (cựu nhân viên Viện 4.0 Trường Đại học Đông Đô) và Ngô Quang Hiển (cựu nhân viên Viện Đào tạo liên tục Trường đại học Đông Đô).
Theo cáo trạng, từ tháng 4/2018 đến tháng 3/2019, Trần Khắc Hùng (Chủ tịch Hội đồng quản trị Trường Đại học Đông Đô đang bỏ trốn) và đồng phạm đã làm, cấp bằng, giấy chứng nhận giả cho 431 trường hợp, thu lợi bất chính số tiền hơn 7,1 tỷ đồng. Quá trình điều tra vụ án, cơ quan điều tra đã làm rõ được 210 trường hợp để kiến nghị xử lý theo quy định, còn 221 trường hợp được cấp văn bằng giả đã xác định được họ tên, tuổi người được cấp bằng nhưng không xác định được nơi cư trú, đơn vị công tác.
Trong vụ án này, Trần Khắc Hùng là người có vai trò chủ mưu, khởi xướng, tổ chức và chỉ đạo các bị cáo khác thực hiện hành vi phạm tội. Tuy nhiên, do Trần Khắc Hùng đã bỏ trốn nên Cơ quan An ninh điều tra (Bộ Công an) đã ra quyết định tạm đình chỉ điều tra bị can, khi nào bắt được xử lý sau. Người được xác định đồng phạm, giúp sức tích cực thực hiện hành vi phạm tội với Trần Khắc Hùng là cựu Hiệu trưởng Trường Đại học Đông Đô Dương Văn Hòa. Bị cáo Hoà biết rõ việc làm và cấp văn bằng 2 tiếng Anh không qua tuyển sinh, đào tạo là vi phạm pháp luật nhưng vẫn ký 429 bằng giả.
Cơ quan điều tra đã làm rõ 208 trường hợp được cấp văn bằng giả, xác định được họ tên, tuổi, nơi cư trú, chức vụ, đơn vị công tác. Còn lại 221 trường hợp được cấp văn bằng giả đã xác định được họ tên, tuổi, người được cấp bằng nhưng không xác định được nơi cư trú, đơn vị công tác.
Ngoài ra, bị cáo Hòa còn ký các văn bản quyết định về việc công nhận tốt nghiệp đại học hệ văn bằng 2 chính quy đợt 1, năm 2018 ngày 25/5/2018; quyết định về việc công nhận tốt nghiệp hệ đại học, hệ văn bằng 2 chính quy đợt 1, năm 2018 bổ sung số 315 ngày 2/8/2018; quyết định về việc công nhận tốt nghiệp đại học hệ văn bằng 2 chính quy đợt 1, năm 2018 bổ sung số 514 ngày 2/10/2018; quyết định về việc công nhận tốt nghiệp hệ đại học văn bằng 2 chính quy đợt 2 năm 2018 số 633, ngày 5/12/2018. Bị cáo Hoà còn giới thiệu hai trường hợp là Trần Thị Quỳnh và Hoàng Hạnh Phương để Trường đại học Đông Đô làm thủ tục cấp bằng giả.
Truy tố cựu Hiệu trưởng Đại học Đông Đô và cấp dưới vì cấp bằng giả 
Kết luận điều tra bổ sung vụ án tại Trường Đại học Đông Đô 
