Cụ thể, đánh giá về công tác thu nộp phí, báo cáo của Quỹ bảo trì đường bộ Trung ương cho thấy, còn một số đơn vị có số thu phí sau giờ ngân hàng đến thu tiền hoặc vào ngày thứ bảy, chuyển sang nộp vào ngày hôm sau.
Việc thu này là chưa phù hợp với quy định hiện hành. Dẫn chứng, Trung tâm đăng kiểm 6004D (Đồng Nai) đã để số dư tiền mặt tồn tại quỹ của một số ngày lớn hơn số thu phí trong ngày do đơn vị không nộp ngay trong ngày số thu phí vào tài khoản chuyên thu, có thời điểm sau 14 ngày đơn vị mới nộp ngân hàng.
Cùng đó, một số đơn vị chưa thực hiện hạch toán đầy đủ, hạch toán chưa phù hợp với chế độ kế toán hiện hành hoặc để xảy ra sai sót trong quá trình hạch toán kế toán.