Theo báo cáo của Sở Y tế Hà Nội, đến 18h30 ngày 30/9, trên địa bàn thành phố ghi nhận 2 ca mắc mới tại cộng đồng. Cả 2 ca này đều thuộc quận Hoàn Kiếm và ở chùm sàng lọc ho sốt. Trong đó có bệnh nhân P.Đ.T, nam, SN 1972, quê quán tại Phù Lưu, Lộc Hà, Hà Tĩnh. Bệnh nhân là người nhà vào chăm sóc người bệnh điều trị tại khoa Ung bướu của Bệnh viện Hữu Nghị Việt Đức từ ngày 19/9.
Ngay trong tối 30/9, Hà Nội tiếp tục phát hiện bệnh nhân nam, ở 77 phố Phủ Doãn, phường Hàng Bông (gần Bệnh viện Hữu nghị Việt Đức) nhiễm COVID-19.
Trước đó, ngày 29/9, người này xuất hiện triệu chứng sốt, ngày 30/9 đi khám tại Bệnh viện Medlatec được lấy mẫu xét nghiệm, kết quả dương tính.
Hiện Bệnh viện Hữu Nghị Việt Đức tạm thời phong tỏa tòa nhà D lấy mẫu toàn bộ người nhà, bệnh nhân, nhân viên y tế trong tòa nhà, khoảng 1.400 người. Bệnh viện phối hợp với Trung tâm Y tế quận Hoàn Kiếm, CDC Hà Nội lấy trên 4.000 mẫu xét nghiệm của toàn bộ cán bộ y tế, nhân viên dịch vụ bệnh viện.
Theo Cục trưởng Lương Ngọc Khuê, với quan điểm thích ứng an toàn, linh hoạt, kiểm soát hiệu quả dịch COVID-19, trước mắt, Bệnh viện phối hợp với CDC Hà Nội phải xét nghiệm thật nhanh để xác định vùng nào là vùng xanh, vùng đỏ, vàng tại bệnh viện này.
Hai "vùng đỏ" (Khoa Tiêu hoá và Ung bướu) là nơi có ca dương tính được cách ly ngay. Hai khoa này chỉ tiếp nhận bệnh nhân cấp cứu và bệnh nhân thận nhân tạo, trong đó phải bố trí luồng riêng cho bệnh nhân cấp cứu và phải sàng lọc kỹ đối tượng này. Tạm thời, Bệnh viện chưa tiếp nhận bệnh nhân mới để thực hiện giãn cách trong bệnh viện.
Bộ Y tế sẽ thành lập tổ công tác để cùng với Bệnh viện Việt Đức xây dựng kế hoạch chi tiết phòng, chống dịch và tổ chức khám, chữa bệnh, ngăn chặn, khống chế không để nguồn lây ra cộng đồng.
Bộ Y tế cũng đồng ý với đề xuất của Bệnh viện Hữu nghị Việt Đức điều chuyển thuốc Remdesivir được cấp cho bệnh viện từ Trung tâm Hồi sức Bệnh viện Việt Đức tại TP Hồ Chí Minh chuyển về Bệnh viện Việt Đức để điều trị trường hợp F0 tại bệnh viện. Bệnh viện phối hợp với Sở Y tế Hà Nội giãn cách người nhà bệnh nhân và đề xuất bố trí khách sạn phù hợp bảo đảm sức khỏe cán bộ y tế chống dịch COVID-19 tại bệnh viện.
GS.TS Trần Bình Giang, Giám đốc Bệnh viện Hữu nghị Việt Đức đề nghị Sở Y tế Hà Nội hỗ trợ thực hiện nhanh công tác xét nghiệm và định kỳ xét nghiệm lại sau 3 ngày, 7 ngày và hỗ trợ công tác giãn cách người nhà người bệnh. Bệnh viện sẽ bảo đảm chăm sóc toàn diện cho bệnh nhân ở lại.
Liên quan đến ca dương tính trong Bệnh viện Hữu nghị Việt Đức, CDC Hà Nội đã lấy 1.443 mẫu người nhà, nhân viên tòa nhà D xét nghiệm, đã có 1.433 mẫu có kết quả âm tính. Ba tỉnh đã xác định các ca dương tính liên quan đến Bệnh viện Hữu Nghị Việt Đức gồm: Hà Tĩnh (1 người đưa bố đến khám tại tầng 8 nhà D), Nam Định (3 ca, liên quan người nhà đi chăm sóc bố tại tầng 7 nhà D), Hưng Yên (1 ca là bệnh nhân nằm điều trị tại tầng 8 nhà D đã ra viện).
CDC Hà Nội đề nghị bệnh nhân và người nhà bệnh nhân từng đến khám, chữa bệnh tại Bệnh viện Hữu nghị Việt Đức từ ngày 15/9 đến 30/9 hãy liên hệ ngay với trạm y tế gần nhất, hoặc gọi điện đến đường dây nóng để được hỗ trợ phòng, chống dịch COVID-19. Số điện thoại: 0969.082.115; 0949.396.115
Ngày 30/9, giảm ca mắc và tử vong do COVID-19, khoảng 1 triệu liều vaccine Hayat-Vax đã về Việt Nam 
Phát hiện ca nhiễm COVID-19 tại Bệnh viện Hữu nghị Việt Đức 
