Từ năm 2016 đến nay, Đại úy Huỳnh Nguyễn Phương Thúy đã tham gia đấu tranh khám phá 31 vụ án, bắt 172 đối tượng, thu giữ 245 bánh heroin; 297,418kg ma túy đá; 51,850kg MDMA; 218.805 viên thuốc lắc, 65,754kg ketamine; 6 khẩu súng; 85 viên đạn; 4 quả nổ cùng nhiều tang vật khác.
Về nhiệm vụ tham mưu đấu tranh với tội phạm về ma túy tổng hợp, Đại úy Huỳnh Nguyễn Phương Thúy đã cùng với đơn vị khảo sát, xâm nhập, xác minh, tổ chức đấu tranh triệt xóa 5 tụ điểm tổ chức sử dụng trái phép chất ma túy, chủ yếu là ma túy tổng hợp.
Đại úy Huỳnh Nguyễn Phương Thúy nhớ như in vụ tham gia đấu tranh khám phá thành công vụ án mua bán, vận chuyển ma túy với số lượng lớn từ Campuchia về TP Hồ Chí Minh của nhóm đối tượng do Lê Thị Ngân cầm đầu, phát hiện và triệt phá vào năm 2018. Đại úy Huỳnh Nguyễn Phương Thúy đã cùng các trinh sát Phòng Cảnh sát ĐTTP về ma túy Công an TP Hồ Chí Minh phối hợp với Phòng 5 - Cục Cảnh sát ĐTTP về ma túy Bộ Công an bắt quả tang “nữ quái” Lê Thị Ngân, thu giữ được gần 10kg ma túy đá cất giấu trong một hầm kín được xây dựng dưới nền gạnh men trong nhà của đối tượng.
Đáng nói, ngay lúc đó đối mặt với các điều tra viên, Lê Thị Ngân vẫn khăng khăng cho rằng do kẻ xấu nào muốn hại nên đã tìm cách “chơi” mình. Chỉ đến khi những thông tin, hình ảnh cùng hàng loạt chứng cứ xác thực chứng minh hành vi phạm tội được Cơ quan Công an đưa ra, Ngân mới bắt đầu dịu giọng, nhận tội, rồi quay sang năn nỉ đòi “chung chi” để được giảm hình phạt nhưng bất thành…
Theo tài liệu của cơ quan điều tra, Lê Thị Ngân (SN 1970) sinh ra trong một gia đình không có nghề nghiệp ổn định ở đường An Dương Vương, phường 16, quận 8. Lớn lên, dù Ngân được cha mẹ tạo mọi điều kiện cho ăn học, nhưng mới chưa học hết lớp 5, cô ta đã bỏ học theo đám bạn nam ra bến Phú Định đàn đúm. Tuy nhiên đám bạn này toàn là những đứa nghiện hút ma túy nên chỉ mới gia nhập nhóm chưa đầy một năm, Ngân đã trở thành con nghiện… Sau đó, để có thu nhập, Ngân đã mua ma túy chia nhỏ bán lại các con nghiện kiếm lời.
Năm 1998, sau những đợt truy quét của lực lượng chức năng, Ngân dạt về quận 4, gặp tay anh chị bỏ ma túy cho mình trước đó xin đầu quân. Công việc hàng ngày Ngân được giao là ra những bến ghe, tàu và những khu vực có đông dân lao động cư ngụ để tiếp cận kéo đám con nghiện về mua ma túy của tay anh chị, đồng thời tìm cách dụ dỗ những đối tượng chưa nghiện đi vào con đường hút chích… Sau đó, Ngân nhanh chóng bành trướng địa bàn ra khắp khu vực quận 8 và một phần huyện Bình Chánh, tiếng tăm của Ngân cũng được loan ra rộng rãi trong giới…
Đáng nói, trong quá trình hoạt động, nữ quái này có rất nhiều thủ đoạn để đối phó với cơ quan chức năng, Ngân thường điều hành từ xa và sử dụng rất nhiều tai mắt để cảnh giới nên cơ quan chức năng đã có vài lần truy quét mà cô ta vẫn phi tang tang vật để thoát tội hoặc cho đàn em đứng ra nhận tội thay.
Đến đầu năm 2018, Phòng Cảnh sát ĐTTP về ma túy đã xác lập chuyên án phối hợp với Phòng 5 Cục Cảnh sát ĐTTP về ma túy lên phương án đấu tranh, triệt phá. Ngày 14/3/2018, lực lượng phá án đã bắt quả tang một đàn em của Ngân là Thái Vĩ Dân (SN 1976, ngụ tại đường Văn Thân, phường 6, quận 8) vận chuyển 150gram ma túy từ nhà Ngân đi giao cho đám bán lẻ tại quận 6.
Đến 3h ngày 15/3/2018, Cơ quan Công an tiến hành lệnh bắt khẩn cấp đối với Ngân. Khám xét nơi ở của Ngân, các trinh sát thu giữ 9,3kg ma túy đá. Theo lời khai của Ngân, để có nguồn ma túy, Ngân đích thân đi qua biên giới Mộc Bài, huyện Bến Cầu, tỉnh Tây Ninh, theo đường mòn để tìm gặp, móc nối với những đối tượng cộm cán để bàn chuyện mua chuyển ma túy về bán tại TP Hồ Chí Minh. Sau đó, Ngân giao cho đàn em là Thái Vĩ Dân tiến hành mở rộng địa bàn làm ăn sang các khu vực quận 6, Bình Tân và một phần huyện Bình Chánh.
Để che mắt cơ quan chức năng, Ngân chủ động thuê thêm 2 căn nhà, một để cất giấu ma túy tại nhà không số trong hẻm 230 Phú Định và một căn hộ trong chung cư AVILLA cùng thuộc phường 16, quận 8 để làm chỗ giao dịch. Riêng Thái Vĩ Dân thì thuê thêm căn nhà ở đường Lê Đình Cẩn, phường Tân Tạo, quận Bình Tân làm nơi cất giấu ma túy.
Theo Đại úy Huỳnh Nguyễn Phương Thúy, đường dây ma túy này hoạt động rất tinh vi, các đối tượng thường xuyên đổi địa điểm giao dịch và nơi chứa hàng… Với việc tham gia triệt phá thành công đường dây ma túy lớn này, Đại úy Huỳnh Nguyễn Phương Thúy đã vinh dự được Thủ tướng Chính phủ tặng Bằng khen.
Đặc biệt trong tháng 5/2021, cao điểm của đại dịch COVID-19, với tình hình thành phố thực hiện giãn cách xã hội, người dân thành phố hạn chế ra đường, các đối tượng mua bán ma túy lợi dụng việc nhiều xe chở hàng thiết yếu được ưu tiên cấp mã QR qua chốt kiểm dịch để ngụy trang vận chuyển ma túy vào TP Hồ Chí Minh tiêu thụ.
Sau thời gian xác minh, theo dõi, áp dụng biện pháp nghiệp vụ, ngày 19/8/2021, Đại úy Huỳnh Nguyễn Phương Thúy cùng các đồng nghiệp của Phòng Cảnh sát ĐTTP về ma túy phối hợp với các đơn vị đã khám phá đường dây vận chuyển ma túy từ Campuchia về Việt Nam bằng cách ngụy trang ma túy trong các cần xe cá khô, vận chuyển bằng xe ôtô luồng xanh vào thành phố. Kết quả, đơn vị đã bắt tạm giam 4 đối tượng, thu giữ: 99,648kg ma túy các loại (59,957kg MA; 92 bánh heroin trọng lượng 32,386kg; 20.000 viên thuốc lắc trọng lượng 7,305kg MDMA)…
Mới đây, Đại úy Huỳnh Nguyễn Phương Thúy đã vinh dự đại diện cho Công an TP Hồ Chí Minh tham gia huấn luyện tại Đơn vị Cảnh sát gìn giữ hoà bình Liên hiệp quốc…
Với các thành tích đã đạt được, Đại úy Huỳnh Nguyễn Phương Thúy đã được tặng nhiều giải thưởng, bằng khen của các cấp lãnh đạo. Trong đó, năm 2021, chị được tuyên dương “Công dân trẻ TP Hồ Chí Minh tiêu biểu”, nhận giải thưởng “Gương mặt trẻ Công an tiêu biểu”. Năm 2022, chị được tặng danh hiệu “Thanh niên tiên tiến làm theo lời Bác” (TP Hồ Chí Minh), “Thanh niên tiên tiến làm theo lời Bác cụm miền Đông Nam Bộ” năm 2023. Tháng 6/2022, chị vinh dự được nhận danh hiệu Chiến sĩ thi đua toàn lực lượng CAND...
Tháng 9/2023, Đại úy Huỳnh Nguyễn Phương Thúy vinh dự là 1 trong 32 gương thanh niên của Tuổi trẻ Bộ Công an được nhận danh hiệu “Thanh niên tiên tiến làm theo lời Bác toàn quốc” tại Đại hội Thanh niên tiên tiến làm theo lời Bác lần thứ VII; và mới đây ngày 17/5/2025, chị tiếp tục được nhận danh hiệu này. Ngày 19/5/2025, Đại úy Huỳnh Nguyễn Phương Thúy được Thành ủy TP Hồ Chí Minh biểu dương gương điển hình trong phong trào học tập và làm theo tư tưởng, đạo đức, phong cách Hồ Chí Minh…
Nữ trinh sát có duyên phá án 
Chuyện nghề của nữ trinh sát phòng, chống tội phạm ma túy 
