Các bị cáo trong vụ án này thuộc 2 nhóm: Nhóm thứ nhất thuộc Công ty Tân Thuận (trực thuộc Văn phòng Thành ủy TP Hồ Chí Minh) và nhóm bị cáo nguyên là cán bộ Văn phòng Thành ủy.
Sau thời gian nghị án kéo dài, HĐXX cấp phúc thẩm đã sửa một phần bản án sơ thẩm và tuyên phạt mức án với từng bị cáo, cụ thể: Bị cáo Trần Công Thiện bị tuyên phạt 13 năm tù, tổng hợp với bản trước đó trong vụ SADECO, buộc bị cáo chấp hành hình phạt chung là 26 năm tù. Nguyễn Văn Minh (cựu Chủ tịch HĐTV Công ty Tân Thuận) 8 năm tù, tổng hợp với bản án trước đó, buộc bị phải chấp hành hình phạt chung là 11 năm tù; bị cáo Trần Tấn Hải (cựu Phó tổng giám đốc Công ty Tân Thuận) 5 năm tù (y án sơ thẩm); Nguyễn Thị Ngọc Bích (cựu Kế toán trưởng) 2 năm 4 tháng tù (án sơ thẩm 4 năm tù), Nguyễn Hoàng Việt 3 năm tù (y án sơ thẩm), Nguyễn Xuân Tùng (cựu Trưởng hòng Kinh doanh tổng hợp, Công ty Tân Thuận) 4 năm tù (y án sơ thẩm).
Các bị cáo thuộc Nhóm Văn phòng Thành ủy TP Hồ Chí Minh: Phạm Văn Thông (cựu Phó chánh Văn phòng Thành ủy) 11 năm tù, tổng hợp với bản án trước đó, buộc bị cáo chấp hành hình phạt chung là 17 năm tù; Huỳnh Phước Long (cựu Trưởng Phòng quản lý đầu tư kinh doanh vốn, Văn phòng Thành ủy) 9 năm tù, cộng với bản án trước đó, bị cáo phải chịu hình phạt chung là 21 năm tù.
Bị cáo Phan Thanh Tân (cựu Phó chánh Văn phòng Thành ủy) 3 năm tù nhưng cho hưởng án treo. Trước đó, bị cáo này bị TAND TP.HCM tuyên mức án 3 năm tù giam. Tuy nhiên trong quá trình phúc thẩm bị cáo đã nộp bổ sung số tiền khắc phục hậu quả 3,2 tỷ đồng nên được HĐXX xem xét giảm nhẹ hình phạt.
Về trách nhiệm dân sự, HĐXX tuyên buộc các bị cáo liên đới bồi thường theo tỉ lệ đối với số tiền bị thất thoát. HĐXX cũng tuyên tiếp tục kê biên nhiều tài sản của các bị cáo để đảm bảo nghĩa vụ thi hành án.
Ngoài ra HĐXX còn bác kháng nghị của VKSND TP Hồ Chí Minh về việc xác định thời điểm và số tiền thất thoát. Theo HĐXX nhận định cấp sơ thẩm đã xem xét toàn diện, khách quan và căn cứ vào thiệt hại thực tế, do đó, không có cơ sở để chấp nhận kháng nghị này.
Bản án sơ thẩm, TAND TP Hồ Chí Minh xác định tổng thiệt hại là 207 tỉ đồng, trong khi VKSND TP Hồ Chí Minh xác định tổng thiệt hại là 730 tỉ đồng.
Còn với kháng cáo của Công ty Quốc Cường Gia Lai về việc cho nhận lại số tiền 16,9 tỉ đồng đang bị tạm giữ trong tài khoản của Cơ quan ANĐT, Công an TP Hồ Chí Minh, HĐXX cho rằng có cơ sở để chấp nhận và cần trả lại số tiền này cho Công ty Quốc Cường Gia Lai và buộc các bị cáo bồi thường số tiền này cho Công ty Tân Thuận.
Về việc xin tiếp tục thực hiện dự án Khu dân cư Ven Sông của Công ty Quốc Cường Gia Lai không thuộc thẩm quyền xem xét, do vậy HĐXX tiếp tục có kiến nghị giống với bản án sơ thẩm đã nêu đó là giao UBND TP Hồ Chí Minh và các cơ quan có liên quan giải quyết theo quy định về pháp luật đất đai.
Theo bản án sơ thẩm, ông Tất Thành Cang, Trần Công Thiện và các đồng phạm đã thực hiện các thủ tục chuyển nhượng phần đất đã đền bù tại 2 dự án là tài sản Nhà nước do Công ty Tân Thuận quản lý là dự án khu dân cư Phước Kiển và dự án khu dân cư Ven Sông cho Công ty Quốc Cường Gia Lai nhưng không thực hiện thẩm định giá, không đảm bảo nguyên tắc thị trường, gây thất thoát tiền của Nhà nước.
Xét xử sơ thẩm, TAND TP Hồ Chí Minh đã tuyên phạt ông Tất Thành Cang (cựu Phó bí thư Thường trực Thành ủy TP TP Hồ Chí Minh) 6 năm tù, ông Cang không kháng cáo; Trần Công Thiện 13 năm tù, các bị cáo khác từ 3 năm đến 11 năm tù về tội “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát lãng phí”.
“Bút phê” bán rẻ đất cho Công ty Quốc Cường Gia Lai, ông Tất Thành Cang bị đề nghị 8 -10 năm tù 
Ông Tất Thành Cang: "Chánh Văn phòng Thành uỷ là người đứng đầu cao nhất chứ không phải bị cáo" 
Truy tố ông Tất Thành Cang và 9 bị can trong vụ bán rẻ 2 dự án đất công 
