Cơ quan CSĐT Bộ Công an xác định, 10 cá nhân tại Ban Quản lý và xây dựng công trình thủy lợi (Ban 1, Bộ NN&PTNT cũ) gồm: ông Đặng Quốc Sự, Trưởng phòng Phòng Thẩm định và thi công cùng 9 cá nhân thuộc phòng này được bị can Vũ Đình Thịnh (Phó Giám đốc Công ty Hoàng Dân) đưa tổng cộng 250 triệu đồng vào các dịp lễ, tết sau khi liên danh đã trúng thầu gói thầu số 17 Dự án hồ Cánh Tạng. Tuy nhiên, các cá nhân này không thỏa thuận nhận tiền, không biết nguồn gốc tiền và đã tự nguyện nộp khắc phục toàn bộ số tiền đã nhận. Các cá nhân này cũng không tham gia, không biết việc Ban 1 thỏa thuận, thông đồng với Nguyễn Văn Dân (Giám đốc Công ty Hoàng Dân) trong đấu thầu; không có hành vi sai phạm trong quá trình tham gia đấu thầu, thi công nên cơ quan điều tra không đủ căn cứ xem xét trách nhiệm hình sự.
Liên quan đến gói thầu số 36 Dự án hồ Bản Mồng, cơ quan điều tra xác định, ông Nguyễn Đăng Thuận (Phó Tổng giám đốc Tổng Công ty 36), ông Phạm Đình Hạnh (Giám đốc Công ty Hoà Hiệp) và ông Nguyễn Quốc Hiệp (Giám đốc Trung tâm CNPM Thủy lợi) không tham gia thỏa thuận xin file dữ liệu dự toán tài chính, không chi tiền cho chủ đầu tư nên cơ quan điều tra không đủ căn cứ xem xét trách nhiệm hình sự.
Đối với 9 cá nhân tại Ban Quản lý và xây dựng công trình thủy lợi 4 (Ban 4, Bộ NN&PTNT cũ), cơ quan điều tra xác định, ông Nguyễn Văn Sơn (Trưởng phòng Quản lý thi công), ông Nguyễn Đức Chính (Phó trưởng phòng Quản lý thi công), ông Đặng Đình Tuấn và ông Đoàn Bình Nguyên, cán bộ Phòng Quản lý thi công, bà Nguyễn Thị Hồng Yến (Trưởng phòng Tài chính kế toán), bà Phan Thị Thủy (cán bộ Phòng Tài chính kế toán), ông Trần Văn Tạo (Phó trưởng Ban Quản lý dự án), ông Nguyễn Anh Tú (Phó trưởng phòng Kế hoạch) và ông Nguyễn Huy Thắng (cán bộ Phòng Kế hoạch) được bị can Hoàng Xuân Thịnh (Phó Giám đốc Ban 4) chi 1,5 tỷ đồng (mỗi cá nhân từ 50 triệu đồng đến 300 triệu đồng) vào các dịp lễ, tết, trong quá trình thi công gói thầu số 36 Dự án hồ Bản Mồng.
Tuy nhiên, các cá nhân trên không thỏa thuận nhận tiền, không biết nguồn gốc tiền và đã tự nguyện nộp khắc phục toàn bộ số tiền đã nhận không tham gia, không biết việc Ban 4 thỏa thuận, thông đồng với bị can Nguyễn Văn Dân trong đấu thầu; không có hành vi sai phạm trong quá trình tham gia đấu thầu, thi công nên cơ quan điều tra không đủ căn cứ xem xét trách nhiệm hình sự.
Đối với ông Trần Văn Tiến (cán bộ Phòng Kế hoạch thẩm định, Ban 8) được bị can Nguyễn Văn Dân cho 75 triệu đồng. Tuy nhiên, ông Tiến không thỏa thuận nhận tiền và đã tự nguyện nộp khắc phục toàn bộ số tiền đã nhận; không tham gia, không biết việc Ban 8 thỏa thuận thông đồng với Nguyễn Văn Dân trong đấu thầu; không có hành vi sai phạm trong qui trình tham gia đấu thầu, thi công nên cơ quan điều tra không đủ căn cứ xem xét trách nhiệm hình sự.
Đối với 3 cá nhân tại Ban Quản lý và xây dựng công trình thủy lợi 2 (Ban 2, Bộ NN&PTNT cũ) gồm: ông Bùi Tuấn Anh (Trưởng phòng Phòng Kế hoạch thẩm định), ông Phạm Văn Thành và ông Lê Duy Thái (nhân viên Phòng Kế hoạch thẩm định) tham gia chấm thầu gói thầu số 21 Dự án hồ Bản Lải. Tuy nhiên, các cá nhân này không biết việc Ban 2 thỏa thuận, thông đồng với Nguyễn Văn Dân trong đấu thầu; không có hành vi sai phạm trong quá trình tham gia đấu thầu, thi công nên cơ quan điều tra không đủ căn cứ xem xét trách nhiệm hình sự.
Liên quan đến vụ án này, cơ quan điều tra cũng xác định, có nhiều cá nhân tại các nhà thầu liên danh với Công ty Hoàng Dân gồm: ông Nguyễn Văn Thạc (Phó Tổng Giám đốc Tổng công ty Thủy lợi 4), ông Trần Hữu Hùng (Tổng Giám đốc Công ty Sông Đà 5), ông Đặng Văn Long (Chủ tịch HĐQT Công ty Lilama 10), ông Đậu Phi Công (Giám đốc Công ty DTC), ông Trần Thế Quang (Giám đốc Công ty Sông Đà 9), ông Nguyễn Hữu Ngọc (Chủ tịch HĐQT kiêm Tổng Giám đốc Tổng Công ty Xây dựng Trường Sơn) cùng nhiều cá nhân khác có tham gia vào hành vi phạm tội của bị can Nguyễn Văn Dân. Tuy nhiên, căn cứ vào tính chất, mức độ và hành vi nên cơ quan điều tra không đủ căn cứ xem xét trách nhiệm hình sự.
Đối với 59 công ty bán hóa đơn cho Công ty Hoàng Dân và các doanh nghiệp trong hệ sinh thái của Công ty Hoàng Dân, cơ quan điều tra xét thấy, hành vi của các công ty này có dấu hiệu phạm tội “In, phát hành, mua bán trái phép hóa đơn, chứng từ thu nộp ngân sách nhà nước” quy định tại Điều 203 BLHS. Các công ty này có địa điểm đăng ký kinh doanh tại nhiều địa phương, một số công ty đã bị công an địa phương khởi tố điều tra về cùng hành vi mua bán trái phép hóa đơn. Vì vậy, ngày 9/8/2025, cơ quan điều tra đã ban hành các quyết định tách hành vi và tài liệu liên quan, chuyển Công an các tỉnh, thành phố: Ninh Bình, Đắk Lắk, Hải Phòng, Lạng Sơn, Hà Nội và Khánh Hòa để tiếp tục điều tra, xử lý theo quy định pháp luật.
Ngoài các bị can đã khởi tố và đề nghị truy tố, còn có một số cá nhân có hành vi, vi phạm liên quan ở các mức độ khác nhau nhưng chưa đủ căn cứ xem xét trách nhiệm hình sự hoặc chưa đến mức truy cứu trách nhiệm hình sự. Căn cứ tính chất, mức độ của hành vi sai phạm, Cơ quan CSĐT Bộ Công an có văn bản kiến nghị các cơ quan chủ quản xử lý nghiêm theo quy định của pháp luật.
Nhận hối lộ 200.000 USD, cựu Thứ trưởng Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn bị đề nghị truy tố 
Khởi tố nguyên Thứ trưởng Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn Hoàng Văn Thắng và các đồng phạm 
