Trong số 23 bị can bị đề nghị truy tố với nhiều tội danh khác nhau, cựu Thứ trưởng Bộ NN&PTNT Hoàng Văn Thắng bị đề nghị truy tố về tội “Nhận hối lộ”.
Cùng bị đề nghị truy tố về tội “Nhận hối lộ” là các bị can: Trần Tố Nghị (cựu Quyền Cục trưởng Cục Quản lý Xây dựng công trình - QLXDCT, Bộ NN&PTNN; Nguyễn Hải Thanh (cựu Phó Cục trưởng Cục QLXDCT, kiêm Giám đốc Ban 4); Trần Văn Lăng (cựu Giám đốc Ban 2); Lê Văn Hiến (cựu Giám đốc Ban 8).
Bị can Nguyễn Văn Dân (Giám đốc Công ty Hoàng Dân) bị đề nghị truy tố về 3 tội: “Vi phạm quy định về kế toán gây hậu quả nghiêm trọng”, “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng” và “Đưa hối lộ”.
Ngoài các bị can trên, 14 bị can bị đề nghị truy tố về tội “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng” và 3 bị can bị đề nghị truy tố về tội “Vi phạm quy định về kế toán gây hậu quả nghiêm trọng”.
Theo kết luận điều tra, do có quan hệ từ trước, Nguyễn Văn Dân đã câu kết, thỏa thuận chi tiền cho cựu Thứ trưởng Bộ NN&PTNT Hoàng Văn Thắng và các bị can khác ở Cục QLXDCT để các bị can này tác động, chỉ đạo giám đốc các ban.
Nguyễn Văn Dân cũng đồng thời thỏa thuận chi tiền để giám đốc các ban chỉ đạo cấp dưới cung cấp hồ sơ, dữ liệu giá thầu trước thời điểm phát hành hồ sơ mời thầu.
Việc này tạo điều kiện cho Công ty Hoàng Dân và liên danh trúng 5 gói thầu tại 4 dự án. Hành vi của Nguyễn Văn Dân đã gây thiệt hại tài sản Nhà nước hơn 251 tỷ đồng tại 5 gói thầu thuộc 4 dự án. Ngoài ra, Nguyễn Văn Dân còn có hành vi đưa hối lộ với số tiền hơn 40 tỷ đồng.
Kết luận điều tra cho thấy, bị can Hoàng Văn Thắng đã nhận hối lộ 200.000 USD (tương đương 4,54 tỷ đồng). Trong đó, nhận hối lộ của Nguyễn Văn Dân liên quan đến gói thầu số 36 Hồ Bản Mảng 500 triệu đồng và nhận 50.000 USD của Trần Văn Lăng vào dịp lễ, tết. Cơ quan điều tra không xác định là tiền hối lộ, nhưng do số tiền trên có nguồn gốc là của Nguyễn Văn Dân nên cơ quan điều tra thấy cần phải thu hồi để khắc phục hậu quả cho Nhà nước.
Bị can Trần Tố Nghị đã nhận hối lộ 13 tỷ đồng, trong đó nhận của Nguyễn Văn Dân liên quan gói thầu số 36 Dự án Hồ Bản Mảng cùng hai gói thầu số 13 và số 17 Dự án hồ Krông Pach Thượng; bị can Nguyễn Hải Thanh nhận hối lộ 6,25 tỷ đồng, trong đó nhận của Nguyễn Văn Dân liên quan gói thầu số 36 Dự án Hồ Bản Mảng; bị can Trần Văn Lăng nhận hối lộ 13,425 tỷ đồng và bị can Lê Văn Hiến nhận hối lộ 3 tỷ đồng.
Quá trình điều tra, các bị can đều thành khẩn khai báo, ăn năn hối cải và tích cực hợp tác với cơ quan điều tra để làm rõ bản chất vụ án. Các bị can đã tự nguyện nộp lại số tiền hưởng lợi bất hợp pháp và khắc phục hậu quả vụ án.
Khởi tố nguyên Thứ trưởng Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn Hoàng Văn Thắng và các đồng phạm 
