Những hạn chế, sai phạm kể trên vừa được Thanh tra TP Hồ Chí Minh nêu rõ trong Thông báo Kết luận thanh tra về trách nhiệm Chủ tịch UBND huyện Cần Giờ trong việc thực hiện pháp luật về thanh tra, tiếp công dân, xử lý đơn, khiếu nại, tố cáo; việc chỉ đạo điều hành trong công tác phòng, chống dịch bệch COVID-19 và trách nhiệm của UBND huyện Cần Giờ trong quản lý, sử dụng ngân sách và việc chấp hành về thực hành tiết kiệm, chống lãng phí trong quản lý, sử dụng ngân sách trên địa bàn huyện Cần Giờ.
Trong khoảng thời gian từ ngày 1/1/2020 đến ngày 31/12/2021, Thanh tra TP Hồ Chí Minh cho rằng trong công tác tiếp nhận, mua sắm, quản lý, sử dụng test kit xét nghiệm và vaccine phòng COVID-19, Trung tâm Y tế huyện Cần Giờ phân bổ test kit xét nghiệm nhanh từ Trung tâm Kiểm soát bệnh tật TP Hồ Chí Minh (HCDC) đến các Trạm Y tế xã, thị trấn đã không lưu giữ đầy đủ hồ sơ, thông tin, chữ ký, danh sách của toàn bộ cá nhân đã được xét nghiệm.
Việc này Thanh tra TP Hồ Chí Minh khẳng định lãnh đạo huyện Cần Giờ quản lý chưa chặt chẽ theo quy định về quản lý sử dụng tài sản công; thực hiện chỉ định thầu cũng chưa phù hợp pháp luật về đấu thầu.
Ngoài ra, Trung tâm Y tế huyện Cần Giờ để 6.828 liều Vaccine Pfizer hết hạn sử dụng nhưng chưa kịp thời đề xuất xử lý đến Sở Y tế, HCDC thành phố và UBND huyện Cần Giờ là quản lý tài sản công chưa hiệu quả.
Về chi hỗ trợ cho các cá nhân bị ảnh hưởng do dịch COVID-19, Thanh tra thành phố cho rằng UBND huyện Cần Giờ thực hiện hỗ trợ (theo Nghị quyết số 68/NQ-CP của Chính phủ) còn chậm trễ, dẫn đến phần lớn các trường hợp đã kết thúc việc cách ly y tế từ tháng 10, 11, 12/2021 nhưng đến tháng 8/2022 mới được phê duyệt hỗ trợ; đến nay, vẫn còn một số trường hợp chưa nhận được tiền hỗ trợ.
Việc ban hành Quyết định phê duyệt danh sách hỗ trợ tại một số trường hợp có thiếu sót khi chưa thể hiện đầy đủ thông tin về Quyết định và thời gian cách ly, ngày bắt đầu cách ly, ngày giải tỏa cách ly, thời gian nhập viện, xuất viện.
UBND xã Thạnh An tạm ứng Ngân sách xã chi hỗ trợ theo Nghị quyết số 68/NQ-CP cho 77 trường hợp F1, F0 với số tiền hơn 86 triệu đồng, đã báo cáo Phòng Y tế huyện nhưng đến nay chưa xử lý dứt điểm.
Trong thực hiện nhiệm vụ thu - chi ngân sách do UBND TP Hồ Chí Minh giao, nhất là việc chi đầu tư phát triển, Thanh tra thành phố nhấn mạnh hầu hết các dự án của Cần Giờ trong số 413 dự án đang được theo dõi thực hiện đều chậm tiến độ hoặc chậm quyết toán theo quy định.
Trong đó, theo báo cáo của UBND huyện Cần Giờ có 24 dự án đã quyết toán từ năm 2018 đến ngày 30/11/2022 nhưng chủ đầu tư chưa thực hiện hoàn trả khoản chênh lệch do số tiền thanh toán cao hơn số quyết toán là 896 triệu đồng, là chưa đúng quy định…
Các khoản kinh phí bổ sung có mục tiêu từ ngân sách thành phố cho ngân sách huyện không sử dụng hết hiện kết dư với tổng số tiền là hơn 32 tỷ đồng (gồm các khoản chi có mục tiêu đầu tư xây dựng công trình không sử dụng hết từ năm 2016 trở về trước hơn 31 tỷ đồng; kinh phí hỗ trợ tiêu thụ muối gần 842 triệu đồng) mà không nộp hoàn trả phần còn thừa cho ngân sách thành phố là thực hiện chưa đúng theo quy định.
Cơ quan Thanh tra cũng chỉ rõ UBND huyện Cần Giờ đã thực hiện không đúng quy định khi tạm giao diện tích đất 19.751,2m2 tại thị trấn Cần Thạnh cho Doanh nghiệp tư nhân Phú Hào Khang. Đến nay, doanh nghiệp này không còn hoạt động tại địa phương, không nộp tiền thuê đất làm thất thu tiền thuê đất của Nhà nước với số tiền thuê đất tạm tính là hơn 777 triệu đồng.
Việc thu ngân sách từ xử lý vi phạm hành chính trong một số lĩnh vực trong năm 2020 và 2021, các cơ quan có thẩm quyền thuộc huyện Cần Giờ đã tham mưu, ban hành 1.758 quyết định xử phạt vi phạm hành chính với số tiền hơn 5,2 tỷ đồng trên các lĩnh vực đất đai, xây dựng, an ninh trật tự, an toàn vệ sinh thực phẩm... Tuy nhiên, huyện chỉ mới thu nộp ngân sách Nhà nước số tiền hơn 1 tỷ đồng…
UBND huyện Cần Giờ cũng thực hiện việc tạm ứng chi hỗ trợ lãi vay và thanh toán tạm ứng không đúng theo quy định dẫn đến phát sinh khoản hỗ trợ đã tạm ứng cho ngân hàng nhưng đến nay không đảm bảo thủ tục thanh toán là hơn 2,5 tỷ đồng, trong đó số tiền hơn 616 triệu đồng chi sai quy định cần phải thực hiện thu hồi ngay để tránh thất thoát tài sản nhà nước.
Với các sai phạm trên, Chánh Thanh tra thành phố đã kiến nghị Chủ tịch UBND TP Hồ Chí Minh chỉ đạo giao Chủ tịch UBND huyện Cần Giờ tổ chức kiểm điểm trách nhiệm các tổ chức, cá nhân có liên quan đến những vi phạm nêu trên và khẩn trương chấn chỉnh, khắc phục các hạn chế, thiếu sót…
Chỉ đạo thu hồi 896 triệu đồng là khoản chênh lệch giữa giá trị thanh toán lớn hơn số quyết toán/24 dự án mà các chủ đầu tư chưa hoàn trả Ngân sách Nhà nước theo quy định; đồng thời, khẩn trương chỉ đạo thu hồi ngay số tiền hơn 616 triệu đồng đã tạm ứng cho ngân hàng nhưng chi sai quy định để nộp hoàn trả ngân sách nhà nước. Trường hợp các tổ chức tín dụng tiếp nhận tạm ứng nhưng không hoàn trả đúng thời hạn quy định thì chuyển Cơ quan Cảnh sát điều tra để xử lý…
Nhiều tồn tại, thiếu sót trong quản lý, sử dụng tài sản công tại quận 10 
Sở NN&PTNT TP Hồ Chí Minh còn nhiều thiếu sót trong quản lý, sử dụng đất đai, tài sản công 
Nhiều tồn tại trong tuyển dụng lao động, quản lý tài sản công 
