Trước đó, Viện KSND tối cao đã hai lần trả hồ sơ, yêu cầu Cơ quan điều tra Bộ Công an điều tra bổ sung vụ án này. Tháng 8/2022, Viện KSND tối cao đã ban hành cáo trạng truy tố 34 bị can về các tội nhận hối lộ, môi giới hối lộ, lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ và sản xuất, buôn bán hàng giả.
Bị can Trần Hùng, cựu Phó Chánh Văn phòng Thường trực Ban Chỉ đạo quốc gia chống buôn lậu (viết tắt là Ban Chỉ đạo 389), cựu Tổ trưởng Tổ 304 thuộc Tổng cục Quản lý thị trường bị truy tố về tội “Nhận hối lộ” do có hành vi nhận 300 triệu đồng của một phụ nữ buôn sách giả, qua đó giúp người phụ nữ này không bị xử lý hình sự.
Bị can Cao Thị Minh Thuận (Giám đốc Công ty Phú Hưng Phát), bị can Hoàng Mạnh Chiến (Giám đốc Công ty cổ phần In và Văn hóa truyền thông Hà Nội) và 28 bị can khác bị truy tố về tội “Sản xuất, buôn bán hàng giả”.
Ba cựu cán bộ Đội Quản lý thị trường số 17 bị truy tố về tội “Lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ” gồm: Lê Việt Phương (cựu Phó Đội trưởng), Phạm Ngọc Hải và Thành Thị Đông Phương (cùng là cựu Kiểm soát viên).
Bị can Nguyễn Duy Hải (lao động tự do) bị truy tố về tội “Môi giới hối lộ”.
Như Báo CAND đã đưa tin, năm 2021, Cao Thị Minh Thuận cùng đồng phạm đặt in, nhập kho hơn 9,3 triệu quyển sách giả các loại liên quan Nhà Xuất bản Giáo dục. Nhóm bị can này được xác định đã tiêu thụ hơn 6,3 triệu quyển, còn 3 triệu quyển chưa kịp bán bị cơ quan Công an phát hiện và thu giữ.
Ngày 9/7/2020, Cao Thị Minh Thuận bị Đội Quản lý thị trường số 17 phối hợp Tổ 304 thuộc Tổng cục Quản lý thị trường (nơi bị can Trần Hùng làm Tổ trưởng kiểm tra) đã phát hiện và thu giữ hơn 27.000 quyển sách giả.
Tuy nhiên, sự việc trên không được Trần Hùng báo cáo với Tổng Cục trưởng Tổng cục Quản lý thị trường, mà bị can Trần Hùng trực tiếp chỉ đạo Cục Quản lý thị trường Hà Nội và Đội Quản lý thị trường số 17 kiểm tra, xử lý.
Sau đó, Cao Thị Minh Thuận đã nhắn tin, điện thoại cho Trần Hùng nhờ giúp đỡ xin xử lý nhẹ vụ việc. Trần Hùng đồng ý giúp đỡ với yêu cầu, Cao Thị Minh Thuận phải chỉ ra một số cơ sở in lậu.
Sau đó, Cao Thị Minh Thuận tiếp tục liên hệ với Nguyễn Duy Hải đặt vấn đề chi 400 triệu đưa cho Trần Hùng để xin xử lý nhẹ vụ việc. Nguyễn Duy Hải đã gặp Trần Hùng đặt vấn đề chi 400 triệu và xin bỏ qua vụ việc buôn sách lậu.
Trần Hùng đã hướng dẫn Nguyễn Duy Hải về nói với Cao Thị Minh Thuận phải thay đổi lời khai về nguồn gốc số sách, từ “sách mua bị thu giữ” sang “sách do người khác mang đến ký gửi” để được giảm nhẹ hình thức xử phạt.
Ngày 15/7/2020, Nguyễn Duy Hải cầm 300 triệu đựng trong túi ni lông màu đen đến phòng làm việc của Trần Hùng. Tại đây, Nguyễn Duy Hải đã gọi điện để Trần Hùng nói chuyện và hướng dẫn Cao Thị Minh Thuận viết lại bản tường trình thay đổi lời khai nguồn gốc sách bị thu giữ. Sau đó, Trần Hùng còn chỉ đạo cấp dưới tạo điện kiện giúp đỡ Cao Thị Minh Thuận theo hướng, xử lý hành chính vụ buôn sách lậu.
Quá trình điều tra, Trần Hùng không thừa nhận hành vi nhận hối lộ. Tuy nhiên, Viện KSND tối cao xác định, căn cứ lời khai các bị can khác, các dữ liệu điện tử trích xuất từ điện thoại… có đủ cơ sở xác định, Trần Hùng đã nhận hối lộ 300 triệu đồng để xử lý nhẹ vụ buôn sách lậu.
Liên quan đến vụ án này, Lê Việt Phương đã chỉ đạo Thành Thị Đông Phương xây dựng hồ sơ, báo cáo để xuất xử lý hành chính vụ việc theo ý kiến của Trần Hùng và nhận 310 triệu tiền... cám ơn.
Phạm Ngọc Hải được giao nhiệm vụ chủ trì tiêu hủy số sách lậu nhưng đã làm trái công vụ, tự ý trả lại một phần số sách thu giữ và nhận 30 triệu tiền... cám ơn.
Cáo trạng xác định, hành vi của các bị can đã làm trái công vụ, dẫn đến hậu quả vụ việc vi phạm có dấu hiệu hình sự nhưng chỉ bị xử lý hành chính, xâm phạm đến hoạt động đúng đắn của cơ quan Nhà nước, làm ảnh hưởng đến uy tín, hình ảnh của lực lượng quản lý thị trường.
Bị can Trần Hùng bị truy tố về tội nhận hối lộ 
