Theo đại diện Viện kiểm sát, bị cáo Nguyễn Lộc An với vai trò là Trưởng đoàn kiểm tra điều kiện cấp giấy phép kinh doanh xăng dầu, mặc dù biết rõ Công ty Bách Khoa Việt và Công ty Long Hưng không đủ điều kiện được cấp giấy phép xuất khẩu, nhập khẩu xăng dầu, nhưng vì vụ lợi nên An đã lợi dụng chức vụ quyền hạn của mình gợi ý, đề nghị bà Trần Thị Loan Phương (Chủ tịch HĐQT Công ty Bách Khoa Việt) và Nguyễn Tuấn Quỳnh (Chủ tịch HĐTV Công ty Long Hưng) đưa hối lộ và nhiều lần nhận hối lộ của Phương và Quỳnh với tổng số tiền 14,2 tỷ đồng.
Từ đây, bị cáo An tạo điều kiện cho Công ty Bách Khoa Việt được cấp giấy xác nhận đủ điều kiện làm thương nhân phân phối xăng dầu và giấy phép kinh doanh xuất khẩu, nhập khẩu xăng dầu; Công ty Long Hưng được cấp giấy phép kinh doanh xuất nhập, nhập khẩu xăng dầu trái quy định gây ảnh hưởng xấu đến hoạt động trong lĩnh vực xăng dầu, là lĩnh vực quan trọng về an ninh năng lượng, phục vụ phát triển kinh tế, phục vụ đời sống người dân.
Viện kiểm sát đánh giá, bị cáo An đã chủ động gợi ý để nhận hối lộ nhiều lần với số tiền lớn, do đó bị cáo bị áp dụng tình tiết tăng nặng trách nhiệm hình sự là phạm tội từ hai lần trở lên. Tuy nhiên, bị cáo An có tình tiết giảm nhẹ là có nhiều thành tích trong công tác, được tặng nhiều bằng khen, giấy khen, gia đình bị cáo An đã nộp đủ 14,2 tỷ đồng nhận hối lộ để sung công quỹ Nhà nước. Ngoài ra, bị cáo An có cha mẹ tham gia kháng chiến chống Mỹ, được tặng thưởng Huân chương kháng chiến nên được áp dụng thêm tình tiết giảm nhẹ một phần hình phạt.
Đối với bị cáo Nguyễn Tuấn Quỳnh, đại diện Viện kiểm sát nhận thấy, bị cáo là Chủ tịch HĐTV Công ty Long Hưng nên đã liên hệ để nhờ bị cáo An giúp có được giấy phép. Sau khi được An giúp đỡ có giấy phép trái quy định và được An gợi ý, doanh nghiệp của Quỳnh đã đưa cho An 5 tỷ đồng. Viện kiểm sát nhận thấy, doanh nghiệp của Quỳnh do sợ An gây khó khăn trong việc kinh doanh xăng dầu nên phải đồng ý chi cho An 5 tỷ đồng nên hành vi phạm tội của Quỳnh là có mức độ.
Sau khi đưa hối lộ, Quỳnh nhận thức được sai phạm nên khi cơ quan điều tra triệu tập để làm rõ, Quỳnh đã có đơn tố cáo trình bày rõ việc nhận hối lộ của An, đồng thời tích cực phối hợp cung cấp tài liệu để cơ quan điều tra nhanh chóng làm rõ bản chất vụ án.
Quá trình hoạt động, Quỳnh đã chỉ đạo doanh nghiệp của mình khắc phục hậu quả. Công ty Long Hưng được tặng nhiều bằng khen, giấy khen, có thành tích hỗ trợ người lao động, khôi phục sản xuất trong và sau dịch bệnh COVID - 19… Cá nhân Quỳnh cũng được tặng nhiều giấy khen và được Uỷ ban MTTQ quận Phú Nhuận, TP Hồ Chí Minh biểu dương đạt danh hiệu người tốt, việc tốt.
Hiện tại, bị cáo Quỳnh bị suy thận mãn tính giai đoạn cuối và đã phẫu thuật ghép thận 2 lần, đang phải điều trị dung thuốc chống thải ghép, tỷ lệ tổn thương cơ thể 81%. Ngoài ra, Quỳnh còn bị các bệnh đái tháo đường tupe 2, viên gan siêu vi B-C nên được đại diện Viện kiểm sát đề nghị Hội đồng xét xử áp dụng các tình tiết giảm nhẹ trách nhiệm hình sự để giảm nhẹ một phần hình phạt cho bị cáo.
Đối với hai bị cáo Trần Trác Việt Đức (Giám đốc Công ty Bách Khoa Việt) và Đỗ Thị Tuyết Nga (Kế toán trưởng Công ty Bách Khoa Việt), đại diện Viện kiểm sát nhận thấy, quá trình điều tra và tại phiên tòa, hai bị cáo thành khẩn khai báo, tích cực hợp tác với cơ quan điều tra, nhanh chóng làm rõ bản chất vụ án. Hai bị cáo cũng được gia đình giúp nộp một phần tiền khắc phục hậu quả vụ án. Hai bị cáo cũng chỉ là đồng phạm giúp sức nên được xem xét giảm nhẹ một phần trách nhiệm hình sự.
Từ những phân tích, đánh giá trên, đại diện Viện kiểm sát đề nghị Hội đồng xét xử tuyên phạt bị cáo Nguyễn Lộc An từ 12-13 năm tù về tội “Nhận hối lộ”. Tổng hợp với bản án 4 năm tù trước đó, bị cáo An phải chấp hành hình phạt chung theo quy định của pháp luật. Ngoài đề nghị hình phạt tù, đại diện Viện kiểm sát còn đề nghị Hội đồng xét xử tuyên buộc bị cáo An cấm đảm nhiệm chức vụ liên quan đến hoạt động kinh doanh thương mại từ 4-5 năm kể từ khi chấp hành xong hình phạt tù; phạt bổ sung 100 triệu đồng.
Bị cáo Nguyễn Tuấn Quỳnh bị đề nghị 36 tháng tù cho hưởng án treo về tội “Đưa hối lộ”, thời gian thử thách 5 năm; phạt bổ sung 50 triệu đồng.
Bị cáo Trần Trác Việt Đức bị đề nghị từ 11-12 năm tù về tội “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí”; cấm đảm nhiệm chức vụ liên quan đến hoạt động kinh doanh thương mại từ 4-5 năm kể từ khi chấp hành xong hình phạt tù.
Bị cáo Đỗ Thị Tuyết Nga bị đề nghị từ 3-4 năm tù về tội “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí”; cấm đảm nhiệm chức vụ, làm công việc liên quan đến lĩnh vực kế toán, tài chính trong các doanh nghiệp từ 1-2 năm kể từ khi chấp hành xong hình phạt tù.
Về số tiền bị cáo Nguyễn Lộc An hưởng lợi bất hợp pháp từ hành vi nhận hối lộ, đại diện Viện kiểm sát đề nghị Hội đồng xét xử tuyên tịch thu xung công quỹ Nhà nước.
Xét xử cựu Phó Vụ trưởng Bộ Công thương nhận hối lộ để mua biệt thự 
Cựu Phó Vụ trưởng Bộ Công thương lại bị đề nghị truy tố trong vụ án mới 
