Theo Bộ GD&ĐT, sau gần một thập kỉ triển khai, Quyết định số 1981/QĐ-TTg ngày 18/10/2016 của Thủ tướng Chính phủ phê duyệt Khung cơ cấu hệ thống giáo dục quốc dân và Quyết định số 1982/QĐ-TTg ngày 18/10/2016 của Thủ tướng Chính phủ phê duyệt Khung trình độ quốc gia Việt Nam đã góp phần quan trọng trong việc chuẩn hóa hệ thống giáo dục, thúc đẩy liên thông, bảo đảm chất lượng đào tạo và tăng cường hội nhập quốc tế.
Tuy nhiên, qua thực tiễn triển khai cho thấy còn một số hạn chế, như cấu trúc hệ thống còn thiên về mô tả hành chính; cơ chế phân luồng và liên thông chưa rõ ràng; mô tả các bậc trình độ còn dàn trải, thiếu tính đo lường; chưa phản ánh đầy đủ đặc thù của một số lĩnh vực đào tạo cũng như yêu cầu của thị trường lao động trong bối cảnh chuyển đổi số và hội nhập sâu rộng.
Việc ban hành các Quyết định mới là cần thiết nhằm cập nhật, hoàn thiện Khung cơ cấu hệ thống giáo dục quốc dân và Khung trình độ quốc gia Việt Nam theo hướng tiếp cận năng lực, tăng cường tính minh bạch, khả năng đối sánh quốc tế, đồng thời bảo đảm sự phù hợp với hệ thống pháp luật giáo dục hiện hành.
Dự thảo Quyết định phê duyệt Khung cơ cấu hệ thống giáo dục quốc dân chuyển Khung cơ cấu từ mô tả hành chính sang khung phân loại cấu trúc. Theo đó, Khung cơ cấu được xác định là khung phân loại và sắp xếp cấu trúc của hệ thống giáo dục quốc dân, làm rõ các cấp học, trình độ đào tạo, các luồng giáo dục và mối quan hệ giữa các yếu tố này, thay vì chỉ liệt kê các bậc học như trước đây. Hệ thống giáo dục được tổ chức theo các cấp độ từ cấp 0 đến cấp 8, bảo đảm thống nhất với Khung trình độ quốc gia và có khả năng tham chiếu với Khung phân loại giáo dục quốc tế (ISCED).
Dự thảo bổ sung quy định về “trung học nghề”, theo đó giáo dục phổ thông được tổ chức thành hai giai đoạn, trong đó giai đoạn giáo dục định hướng nghề nghiệp bao gồm THPT và trung học nghề. Học sinh sau THCS có thể lựa chọn tiếp tục học THPT hoặc trung học nghề phù hợp với nguyện vọng, năng lực và điều kiện thực tế. Khung cơ cấu mới cũng làm rõ hơn cơ chế phân luồng và liên thông sau THCS và THPT, nhấn mạnh các lộ trình học tập mở, tạo cơ sở cho việc liên thông giữa luồng học thuật và luồng nghề nghiệp theo quy định của pháp luật.
Vai trò của giáo dục thường xuyên trong hệ thống được chuẩn hóa theo hướng hỗ trợ học tập suốt đời, đồng thời cho phép chuyển đổi sang các hình thức giáo dục khác khi đáp ứng đủ điều kiện chương trình. Việc tổ chức thực hiện Khung cơ cấu được cập nhật phù hợp với việc sắp xếp bộ máy, trong đó Bộ GD&ĐT chủ trì triển khai Khung cơ cấu đối với các phân hệ, đồng thời nhấn mạnh yêu cầu bảo đảm khả năng tham chiếu với Khung phân loại giáo dục quốc tế.
Ngoài ra, dự thảo cũng lần đầu tiên bổ sung nguyên tắc công nhận học tập trước, liên thông và chuyển đổi, cho phép đánh giá, đối sánh kết quả học tập không chính quy, phi chính quy và kinh nghiệm làm việc với các bậc trình độ trong Khung, làm căn cứ cho việc liên thông và chuyển đổi, phù hợp với thông lệ quốc tế.
Gỡ nút thắt về phân luồng học sinh sau bậc THCS 
Phân luồng học sinh ngay từ bậc trung học cơ sở 
