Qua thanh tra chấn chính chỉnh quản lý, hoàn thiện cơ chế, chính sách pháp luật trên nhiều lĩnh vực; phát hiện vi phạm về kinh tế 85.998 tỷ đồng; 8.777 ha đất. Trong đó, kiến nghị thu hồi 26.654 tỷ đồng và 574 ha đất; xuất toán, loại khỏi giá trị quyết toán do chưa thực hiện đúng quy định và đề nghị cấp có thẩm quyền xem xét xử lý 59.344 tỷ đồng, 8.203 ha đất; ban hành 145.558 quyết định xử phạt vi phạm hành chính của tổ chức, cá nhân với số tiền 5.641 tỷ đồng. Kiến nghị xem xét, xử lý hành chính 3.530 tập thể và 8.619 cá nhân; chuyển cơ quan điều tra xem xét, xử lý 451 vụ, 295 đối tượng.
Đặc biệt trong thanh tra chuyên đề diện rộng về mua sắm trang thiết bị, vật tư y tế, sinh phẩm, kít xét nghiệm, vaccine, thuốc phòng, chống dịch COVID-19, Thanh tra Chính phủ đã thành lập 3 đoàn thanh tra tại Bộ Y tế, Hà Nội, TP Hồ Chí Minh, đồng thời chỉ đạo, hướng dẫn thanh tra các bộ, ngành các bộ, ngành, địa phương tiến hành thanh tra chuyên đề việc mua sắm thanh các bộ, ngành, địa phương tiến hành thanh tra chuyên đề việc mua sắm trang thiết bị, vật tư y tế, sinh phẩm, kít xét nghiệm thuốc phòng, chống dịch COVID-19.
Có 9/20 bộ, ngành và 61/63 tỉnh, thành phố thành lập đoàn thanh tra, đã tiến hành thanh tra 21.383 gói thầu với tổng giá trị 15.475 tỷ đồng. Qua thanh tra cho thấy, công tác đấu thầu mua sắm trang thiết bị, vật tư y tế đã được các đơn vị thực hiện theo quy trình, thủ tục quy định. Tuy nhiên, quá trình mua sắm còn nhiều thiếu sót, khuyết điểm, vi phạm trong việc lập kế hoạch lựa chọn nhà thầu, tổ chức đấu thầu và thực hiện hợp đồng mua sắm tại nhiều địa phương (54/61 tỉnh, thành phố có 4.992/15.909 gói thầu vi phạm). Nhiều địa phương có số gói thầu vi phạm cao như Hà Tĩnh, Đà Nẵng 100%; Hải Phòng 95,8%; Quảng Trị 95,2%; Nam Định 91,3 %; Bình Thuận 90.7%; Cần Thơ 89,3%; Vĩnh Long 85,5 %; Cao Bằng, Điện Biên, Ninh Bình, Hà Giang trên 70%...
Trong đó, có một số vụ việc có dấu hiệu vi phạm pháp luật hình sự, gây thiệt hại cho ngân sách nhà nước. Cơ quan thanh tra đã kiến nghị chuyển 40 vụ việc cho cơ quan điều tra để xem xét, xử lý theo thẩm quyền. Trong đó gồm 2 vụ việc chuyển hồ sơ là việc mua sắm 2 gói thầu vật tư y tế tại Trung tâm kiểm soát bệnh tật TP Hồ Chí Minh; 14 vụ việc chuyển thông tin gồm 3 vụ việc tại Bộ Y tế, 6 vụ việc tại TP Hà Nội; 5 vụ việc tại TP Hồ Chí Minh…
Chuyển hồ sơ sai phạm trong mua sắm trang thiết bị y tế phòng, chống dịch COVID-19 sang Bộ Công an 
Khởi tố 7 bị can vi phạm trong hoạt động đấu thầu mua sắm trang thiết bị giáo dục ở Hà Tĩnh 
