Từ kết luận Thanh tra, Chánh Thanh tra tỉnh Đồng Nai đã chuyển hồ sơ vụ việc sang Cơ quan Cảnh sát điều tra, Công an tỉnh Đồng Nai để tiến hành điều tra xử lý theo quy định pháp luật đối với hành vi giao đất không thông qua đấu giá quyền sử dụng đất; có dấu hiệu tội phạm các quy định quản lý về đất đai theo Điều 229 Bộ luật Hình sự 2015.
Kết luận của Thanh tra tỉnh Đồng Nai xác định, các cá nhân có trách nhiệm liên quan trực tiếp đến sai phạm tại dự án này gồm: Ông Võ Văn Chánh, Phó Chủ tịch UBND tỉnh Đồng Nai nay là Bí thư Thành ủy Biên Hòa; ông Trần Minh Phúc, Phó Chủ tịch UBND tỉnh Đồng Nai; ông Trần Văn Vĩnh, nguyên Phó Chủ tịch UBND tỉnh Đồng Nai; bà Nguyễn Thị Lệ Hồng, Tổng giám đốc Công ty Thực phẩm Công nghiệp Đồng Nai; ông Lê Viết Hưng, nguyên Giám đốc Sở Tài nguyên - Môi trường; ông Huỳnh Văn Huệ, Phó giám đốc Sở Tài chính; ông Nguyễn Thanh Lâm, Phó giám đốc Sở Xây dựng; ông Nguyễn Lục Hòa, Chánh văn phòng UBND tỉnh Đồng Nai; ông Hồ Ngọc Tuấn và ông Hồ Công Tiến, Giám đốc công ty thẩm định viên về giá thuộc Công ty CP thẩm định giá Đồng Nai cùng 2 cán bộ làm việc tại UBND TP Biên Hòa giai đoạn 2012-2015.
Hàng loạt sai phạm đã được Thanh tra tỉnh Đồng Nai chỉ ra tại dự án này, trong đó có những sai phạm được xem là rất nghiêm trọng. Việc cho Công ty Công nghiệp thực phẩm Đồng Nai thuê đất, gia hạn sử dụng đất và giao đất để thực hiện dự án Khu dân cư Bình Đa là không đúng với các quy định của luật đất đai.
Cụ thể, UBND tỉnh Đồng Nai ban hành quyết định thu hồi đất của Công ty LD chế biến lâm sản xuất khẩu Bihimex - Young Linh tại phường Bình Đa rồi chấp thuận cho Công ty Công nghiệp thực phẩm Đồng Nai thuê đất năm 2012, đồng thời lập các thủ tục thanh lý tài sản trên đất cũng như gia hạn cho thuê đất từ năm 2011 đến năm 2012 là không đúng với quy định. Bởi khi công ty giải thể thì Nhà nước thu hồi đất và đấu giá quyền sử dụng đất. Luật đất đai 2003 cũng không quy định trình tự thủ tục thuê đất để thanh lý tài sản trên đất.
Việc UBND tỉnh Đồng Nai chấp thuận cho Công ty Công nghiệp thực phẩm Đồng Nai thuê hơn 24.000m3 đất vào sử dụng sản xuất kinh doanh đến 2016 cũng không đúng với quy định. Trách nhiệm để xảy ra sai phạm nêu trên thuộc về Tổng công ty Công nghiệp thực phẩm Đồng Nai, UBND tỉnh Đồng Nai, Sở Tài nguyên và Môi trường, Văn phòng UBND tỉnh và các cá nhân liên quan.
Nghiêm trọng nhất, ngày 14/11/2016, ông Võ Văn Chánh, Phó Chủ tịch UBND tỉnh Đồng Nai đã ký quyết định về việc giao đất cho Công ty CP phát triển nhà Bình Đa để đầu tư xây dựng dự án khu dân cư Bình Đa. Quyết định này thu hồi gần 2,3 ha đất của Công ty Công nghiệp thực phẩm Đồng Nai để giao cho Công ty CP phát triển nhà Bình Đa với thời hạn 50 năm, không đúng quy định của Luật đất đai 2003. Trong đó, hơn 14.000 m2 đất có thu tiền sử dụng đất để thực hiện dự án. Ngoài ra, quyết định cũng thu hồi, giao gần 9.000 m2 đất sử dụng vào mục đích trồng cây xanh và đường giao thông không thu tiền. Trong khi đó, Công ty CP phát triển nhà Bình Đa chưa nộp tiền ký quỹ vào ngân sách Nhà nước là sai với quy định.
Đến ngày 9/10/2017, Phó Chủ tịch UBND tỉnh Đồng Nai Trần Văn Vĩnh ký quyết định về việc điều chỉnh chấp thuận chủ trương đầu tư dự án khu dân cư Bình Đa. Mức điều chỉnh tăng từ 235 căn lên 325 căn với tổng diện tích xây dựng hơn 54.000 m2. Vốn đầu tư lúc này dự kiến hơn 717 tỷ đồng. Thanh tra xác định, trách nhiệm để xảy ra sai phạm nêu trên thuộc về Tổng công ty Công nghiệp thực phẩm Đồng Nai, UBND tỉnh Đồng Nai, Sở Tài nguyên và Môi trường, Công ty CP phát triển nhà Bình Đa, Chủ tịch UBND tỉnh và Văn phòng UBND tỉnh.
Thanh tra xác định, sau đó việc thỏa thuận địa điểm, phê duyệt quy hoạch xây dựng dự án, chấp thuận chủ trương đầu tư dự án Khu dân cư Bình đa cũng không đúng các trình tự thủ tục và trái với quy định. Việc thuê đất, gia hạn thuê đất cũng như việc giao đất cho công ty CP phát triển nhà Bình Đa thực hiện dự án Khu dân cư Bình Đa không thông qua đấu giá quyền sử dụng đất là là vi phạm quy định của Luật đất đai 2013 và có dấu hiệu tội vi phạm các quy định quản lý đất đai theo Điều 299 Bộ luật Hình sự 2015. Do đó phải chuyển hồ sơ Cơ quan điều tra để điều tra xử lý theo quy định.
Bên cạnh đó, quá trình góp vốn, quản lý, sử dụng vốn và thoái vốn tại Công ty Công nghiệp thực phẩm Đồng Nai cũng xảy ra nhiều sai phạm. Việc UBND tỉnh Đồng Nai chấp thuận chủ trương cho Công ty Công nghiệp thực phẩm Đồng Nai góp vốn bằng tài sản trên đất và lợi thế vị trí địa lý cũng như chấp thuận phê duyệt đề án thành lập Công ty CP phát triển nhà Bình Đa là không đúng với quy định. Việc UBND tỉnh Đồng Nai cho phép Công ty thực phẩm công nghiệp Đồng Nai không phải thực hiện việc chuyển nhượng mua cổ phần phát hành thêm của Tổng công ty tại Công ty CP phát triển nhà Bình Đa là chưa đầy đủ thủ tục.
Kiểm tra việc quản lý, sử dụng hàng loạt khu đất “vàng” ở Biên Hòa 
