Đáng lưu ý, thủ đoạn tinh vi của bị can Huỳnh Thế Năng (SN 1959, cựu Tổng giám đốc Vinafood II) lợi dụng sơ hở trong quản lý nhà nước để “hóa kiếp” đất công.
Theo cơ quan điều tra, hành vi tự ý chuyển nhượng quyền sử dụng đất và tự ý xác định giá trị quyền sử dụng đất là 730 tỷ đồng không đảm bảo khách quan theo giá thị trường để làm căn cứ góp vốn và chuyển nhượng quyền sử dụng đất cho Công ty Việt Hân của Năng là vi phạm pháp luật. Cụ thể, việc tự ý chuyển nhượng phần lớn giá trị quyền sử dụng đất cho Công ty Việt Hân Sài Gòn của Vinafood II là trái với chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ và ý kiến của Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn. Vi phạm quy định về phương thức và thẩm quyền xử lý các cơ sở nhà, đất do công ty nhà nước quản lý, sử dụng theo quy định tại điểm a, khoản 3, Điều 6 Quyết định số 09/2007/QĐ-TTg ngày 19/01/2007 của Thủ tướng Chính phủ về việc sắp xếp lại, xử lý nhà, đất thuộc sở hữu nhà nước.
Về sai phạm chuyển nhượng quyền sử dụng đất cho Công ty Việt Hân với giá 730 tỷ đồng (gồm, chuyển nhượng một phần giá trị quyền sử dụng đất trị giá 570 tỷ đồng vào ngày 23/12/2015 cho Công ty Việt Hân Sài Gòn, chuyển nhượng một phần giá trị quyền sử dụng đất trị giá 160 tỷ đồng vào ngày 30/12/2015 cho Công ty Việt Hân, được hợp thức hóa bằng hình thức chuyển nhượng vốn góp) không thông qua tổ chức bán đấu giá công khai là vi phạm quy định tại khoản 3 và khoản 4 Điều 2 Luật Quản lý, sử dụng vốn nhà nước đầu tư vào sản xuất, kinh doanh tại doanh nghiệp năm 2014.
Đáng lưu ý, tổng chi phí mà Vinafood II đã đầu tư để thực hiện chuyển đổi mục đích sử dụng đất tại 4 cơ sở nhà đất là 766.438.682.519đ, nhưng Huỳnh Thế Năng (với vai trò vừa là thành viên Hội đồng thành viên, vừa là Tổng giám đốc trực tiếp điều hành) vẫn lập tờ trình tham mưu cho Hội đồng thành viên Vinafood II để quyết định giá trị quyền sử dụng đất chỉ là 730 tỷ đồng (thấp hơn chi phí đầu vào là 36.438.682.5194đ) để làm cơ sở cho việc góp vốn và chuyển nhượng quyền sử dụng đất cho Công ty Việt Hân Sài Gòn là vi phạm quy định tại khoản 6, Điều 5, Luật Quản lý, sử dụng vốn nhà nước đầu tư vào sản xuất, kinh doanh tại doanh nghiệp năm 2014 và vi phạm quy định tại khoản 22, Điều 30 và điểm a, khoản 1, Điều 31 Điều lệ Tổ chức và hoạt động của Tổng công ty Lương thực miền Nam.
Mặc dù Năng biết rõ do tình hình tài chính khó khăn nên Vinafood II không có khả năng thực hiện dự án (theo Văn bản số 2022/TCT-VP ngày 23/06/2015 do Năng ký gửi Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn, thì tính đến ngày 30/05/2015 Vinafood II lỗ lũy kế khoảng 1.200 tỷ đồng) và mục đích chính là chuyển nhượng quyền sử dụng đất cho Công ty Việt Hân để thu hồi vốn đầu tư, bù lỗ, trả nợ vay, bổ sung vốn kinh doanh, không phải để tiếp tục thực hiện dự án.
Nhưng, Năng vẫn đại diện Vinafood II ký các văn bản báo cáo Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn, xin chủ trương về phương án góp vốn với Công ty Việt Hân để thành lập mới Công ty Việt Hân Sài Gòn, nhằm mục đích tiếp tục thực hiện dự án, sau đó thoái vốn là báo cáo không trung thực, vi phạm quy định tại khoản 6, Điều 9 Luật Quân lý, sử dụng vốn nhà nước đầu tư vào sản xuất, kinh doanh tại doanh nghiệp. Vinafood II đã chuyển nhượng quyền sử dụng đất cho Công ty Việt Hân, với giá chuyển nhượng do hai bên tự thỏa thuận, không tổ chức chào giá thị trường, không đấu thầu, đấu giá. Như vậy, chưa huy động được các ngồn lực khác tham gia cạnh tranh, tiềm ẩn rủi ro trong chuyển nhượng quyền sử dụng đất là vi phạm nguyên tắc chuyển nhượng vốn được quy định tại điểm b, điểm c, khoản 1, Điều 31 Luật Quản lý, sử dụng vốn nhà nước đầu tư vào sản xuất, kinh doanh tại doanh nghiệp.
Mặt khác, việc Vinafood II chuyển nhượng một phần giá trị quyền sử dụng đất trị giá 570 tỷ đồng cho Công ty Việt Hân Sài Gòn và góp vốn bằng một phần giá trị quyền sử dụng đất trị giá 160 tỷ đồng, khi chưa có giấy chứng nhận quyền sử dụng đất cấp riêng cho từng phần giá trị này hoặc chưa thực hiện các thủ tục đo đạc, tách thửa đôi với phần diện tích cần thực hiện quyền của người sử dụng đất là vi phạm các quy định khoản 1, Điều 188, Luật Đất đai 2013; khoản 1, Điều 79 Nghị định số 43/2014/NĐ- CP ngày 15/05/2014 của Chính phủ về Quy định chi tiết thi hành một số điều của Luật Đất đai 2013. Đồng thời, hợp đồng góp vốn và chuyển nhượng quyền sử dụng đất giữa Vinafood II và Công ty Việt Hân Sài Gòn nêu trên còn vi phạm các quy định sau đây của Luật Kinh doanh bất động sản năm 2014: Khoản 2, Điều 4: “…Bất động sản đưa vào kinh doanh phải có đủ điều kiện theo quy định của Luật này”; khoản 1, Điều 8: “Các hành vi bị cấm: Kinh doanh bất động sản không đủ điều kiện theo quy định của Luật này, điểm a, khoản 2, Điều 9. Các loại đất được phép kinh doanh quyền sử dụng đất phải có đủ các điều kiện sau đây. Cả giấy chứng nhận về quyền sử dụng đất theo quy định của pháp luật về đất đai”.
Tại Cơ quan điều tra, bị can Huỳnh Thế Năng đã thừa nhận toàn bộ hành vi sai phạm liên quan nêu trên. Năng khai, sai phạm của mình không xuất phát từ động cơ vụ lợi mà xuất phát từ áp lực phải thực hiện thoái hóa vốn trong năm 2015. Năng còn nhận thức pháp luật chưa đầy đủ, chưa đúng.
Vụ phù phép chuyển nhượng “đất vàng”: Truy tố cựu lãnh đạo Vinafood II và “đại gia” Đinh Trường Chinh 
Vai trò đắc lực của cựu Phó Tổng giám đốc Vinafood II “hóa kiếp” đất công 
