Theo kết luận điều tra, cựu Bí thư Tỉnh ủy Nguyễn Nhân Chiến và cựu Chủ tịch UBND tỉnh Bắc Ninh Nguyễn Tử Quỳnh, cựu Phó Chủ tịch HĐND tỉnh Bắc Ninh Nguyễn Hạnh Chung và cựu Giám đốc Ban Quản lý Dự án công trình xây dựng Y tế Trần Văn Tuynh cùng bị đề nghị truy tố về tội “Nhận hối lộ”.
Bị can Nguyễn Tiến Nhường, cựu Phó Chủ tịch UBND tỉnh Bắc Ninh bị đề nghị truy tố về tội “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ”. Các bị can khác lần lượt bị truy tố về tội “Đưa hối lộ”, "Lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ” và “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”. Chủ tịch AIC Nguyễn Thị Thanh Nhàn bị đề nghị truy tố về tội danh là “Đưa hối lộ”, hiện Nguyễn Thị Thanh Nhàn đang bỏ trốn đồng thời cũng là bị cáo bị xét xử vắng mặt trong các vụ án khác liên quan đến sai phạm về đấu thầu với án tổng hợp 30 năm tù.
Kết luận điều tra thể hiện, năm 2013, ông Đặng Tiên Phong, Chủ tịch Công ty Sông Hồng (đã mất năm 2021) liên hệ với Trần Văn Tuynh đặt vấn đề ông phụ trách xin vốn bổ sung từ Thủ tướng Chính phủ cho lĩnh vực y tế tại Bắc Ninh. Đổi lại, bị can Tuynh và chính quyền Bắc Ninh phải giúp Công ty Sông Hồng trúng 6 gói thầu thiết bị y tế tại bệnh viện các huyện Quế Võ, Yên Phong, Gia Bình, Lương Tài, Thuận Thành, Tiên Du. Cùng thời gian này, Nguyễn Thị Thanh Nhàn cũng liên hệ với nội dung tương tự. Những lãnh đạo tỉnh Bắc Ninh trong vụ án đã đồng ý để Công ty Sông Hồng sẽ thực hiện 3 gói tại bệnh viện các huyện Yên Phong, Tiên Du, Quế Võ (các huyện phía Bắc sông Đuống), còn Công ty AIC thực hiện 3 gói tại Gia Bình, Thuận Thành, Lương Tài (phía Nam sông Đuống) gây thiệt hại 48 tỷ đồng cho ngân sách.
Cụ thể, bị can Nguyễn Nhân Chiến, nguyên Chủ tịch UBND tỉnh, nguyên Bí thư Tỉnh ủy khai phù hợp với nội dung, diễn biến kết quả điều tra. Chiến thừa nhận việc đồng ý với đề xuất của Đặng Tiên Phong, Lã Tuấn Hưng, Phó Tổng Giám đốc và Nguyễn Thị Thanh Nhàn, Tổng Giám đốc Tổng Công ty AIC trong việc tác động các bộ, ngành Trung ương để xin phân bổ nguồn vốn bổ sung từ Thủ tướng Chính phủ cho tỉnh Bắc Ninh, trong đó có lĩnh vực y tế; thống nhất với Trần Văn Tuynh, Nguyễn Hạnh Chung, Nguyễn Tử Quỳnh về việc phân chia 6 gói thầu, tạo điều kiện để nhóm công ty của Phong, Hưng được tham gia đấu thầu, trúng thầu và ký Hợp đồng thực hiện các Gói thầu mua sắm Thiết bị y tế tại 3 Gói thầu tại BVĐK huyện Tiên Du, Yên Phong, Quế Võ và Công ty AIC được tham gia đấu thầu, trúng thầu và ký Hợp đồng thực hiện các Gói thầu mua sắm Thiết bị y tế tại 3 Gói thầu tại BVĐK huyện Lương Tài, Thuận Thành, Gia Bình sau khi có nguồn vốn được phê duyệt.
Chiến nhận thức hành vi đồng ý chủ trương phân chia 6 gói thầu, tạo điều kiện cho nhóm các công ty của Hưng và Công ty AIC của Nhàn được chỉ định trúng thầu trước khi tổ chức đấu thầu là không đảm bảo khách quan, công bằng, minh bạch trong hoạt động đấu thầu, vi phạm pháp luật về đấu thầu.
Nguyễn Tử Quỳnh, nguyên Phó Chủ tịch UBND tỉnh, nguyên Chủ tịch UBND tỉnh khai phù hợp với nội dung, diễn biến của kết quả điều tra. Quỳnh thừa nhận đồng ý với đề xuất của Đặng Tiên Phong, Lã Tuấn Hưng và Nguyễn Thị Thanh Nhàn trong việc tác động từ Trung ương để xin phân bổ nguồn vốn bổ sung từ Thủ tướng Chính phủ cho tỉnh Bắc Ninh, trong đó có lĩnh vực y tế. Trên cở sở đó, Quỳnh ký Tờ trình gửi Chính phủ, các bộ, ngành đề nghị cấp vốn cho các Dự án đầu tư xây dựng của Ngành y tế tỉnh Bắc Ninh từ nguồn vốn Thủ tướng Chính phủ bổ sung, trong đó, có 6 Dự án BVĐK tuyến huyện tỉnh Bắc Ninh. Đồng thời thống nhất với Trần Văn Tuynh, Nguyễn Hạnh Chung, Nguyễn Nhân Chiến về việc phân chia 6 gói thầu, tạo điều kiện để nhóm Công ty của Phong, Hưng được tham gia đấu thầu, trúng thầu và ký Hợp đồng thực hiện các Gói thầu mua sắm Thiết bị y tế tại 3 Gói thầu tại BVĐK huyện Tiên Du, Yên Phong, Quế Võ và Công ty AIC được tham gia đấu thầu, trúng thầu và ký Hợp đồng thực hiện các Gói thầu mua sắm Thiết bị y tế tại 3 Gói thầu tại BVĐK huyện Lương Tài, Thuận Thành, Gia Bình sau khi có nguồn vốn được phê duyệt. Quỳnh nhận thức hành vi đồng ý phân chia 6 gói thầu, tạo điều kiện cho nhóm các Công ty của Hưng và Công ty AIC của Nhàn được chỉ định trúng thầu trước khi tổ chức đấu thầu là không đảm bảo khách quan, công bằng, minh bạch trong hoạt động đấu thầu, vi phạm pháp luật về đấu thầu.
Nguyễn Tiến Nhường, nguyên Phó Chủ tịch UBND tỉnh khai thừa nhận việc tiếp nhận chỉ đạo từ Nguyễn Nhân Chiến và Nguyễn Tử Quỳnh thông qua Trần Văn Tuynh báo cáo, thống nhất chủ trương phân chia 6 gói thầu; ký các Quyết định phê duyệt dự toán, phê duyệt kế hoạch đấu thầu, tạo điều kiện cho nhóm các Công ty của Hưng và Công ty AIC của Nhàn được chỉ định trúng thầu trước khi tổ chức đấu thầu là không đảm bảo khách quan, công bằng, minh bạch trong hoạt động đấu thầu, vi phạm pháp luật về đấu thầu.
Nguyễn Hạnh Chung, nguyên Giám đốc Sở Y tế, nguyên Phó Chủ tịch HĐND tỉnh Bắc Ninh thừa nhận đồng ý với đề xuất, cùng với Trần Văn Tuynh dẫn Là Tuấn Hưng lên gặp Nguyễn Nhân Chiến, Nguyễn Tử Quỳnh để báo cáo việc phía Công ty Sông Hồng sẽ tác động từ các bộ, ngành Trung ương để xin phân bổ nguồn vốn bổ sung từ Thủ tướng Chính phủ cho tỉnh Bắc Ninh, trong đó có lĩnh vực y tế.
Sau khi có nguồn vốn được phê duyệt, sẽ tạo điều kiện để nhóm Công ty Sông Hồng được tham gia đấu thầu, trúng thầu và ký Hợp đồng thực hiện các Gói thầu mua sắm Thiết bị y tế tại các BVĐK tuyến huyện tỉnh Bắc Ninh; đồng ý với Trần Văn Tuynh về việc phân chia 6 gói thầu, tạo điều kiện để nhóm Công ty Sông Hồng được tham gia đấu thầu, trúng thầu và ký Hợp đồng thực hiện các Gói thầu mua sắm Thiết bị y tế tại 3 Gói thầu tại BVĐK huyện Tiên Du, Yên Phong, Quế Võ và Công ty AIC của Nhàn được tham gia đấu thầu, trúng thầu và ký Hợp đồng thực hiện các Gói thầu mua sắm Thiết bị y tế tại 3 Gói thầu tại BVĐK huyện Lương Tài, Thuận Thành, Gia Bình.
Chung nhận thức hành vi đồng ý phân chia 6 gói thầu, tạo điều kiện cho nhóm các Công ty của Hưng và Công ty AIC của Nhàn được chỉ định trúng thầu trước khi tổ chức đấu thầu là không đảm bảo khách quan, công bằng, minh bạch trong hoạt động đấu thầu, vi phạm pháp luật về đấu thầu. Trần Văn Tuynh cũng khai nhận hành vi phạm tội.
Quá trình này, các lãnh đạo Công ty Sông Hồng là ông Đặng Tiên Phong và bị can Lê Tuấn Hưng đã đưa hối lộ cho Trần Văn Tuynh 6 tỷ đồng. Bị can Tuynh chi lại cho Bí thư Nguyễn Nhân Chiến và Chủ tịch Nguyễn Tử Quỳnh mỗi người 1 tỷ đồng; tặng quà Phó chủ tịch Nguyễn Tiến Nhường nhiều lần, tổng số 300 triệu đồng.
Ngoài ra, bị can Nguyễn Thị Thanh Nhàn cũng đưa hối lộ cho các lãnh đạo nói trên. Bị can Nguyễn Nhân Chiến khai từ năm 2014 đến khi nghỉ hưu năm 2020, vào các dịp lễ tết đều được người phụ nữ này tặng quà.
Tổng cộng, bị can Nhàn có 13 lần lên phòng làm việc của cựu Bí thư Bắc Ninh Nguyễn Nhân Chiến tại trụ sở UBND và Tỉnh ủy Bắc Ninh, mỗi lần đưa từ 500 triệu đến 3 tỷ đồng; tổng số 13 tỷ đồng. Cơ quan điều tra do vậy cáo buộc bị can Chiến nhận hối lộ 14 tỷ đồng từ nguồn tiền của Công ty AIC và Công ty Sông Hồng.
Cựu Bí thư Tỉnh ủy Bắc Ninh khai đã tiêu hết 4 tỷ đồng, còn 10 tỷ, bị can Chiến xin tự nguyện nộp cơ quan điều tra để khắc phục hậu quả.
Tương tự, bị can Nguyễn Tử Quỳnh trong vai trò Phó Chủ tịch, rồi Chủ tịch UBND tỉnh Bắc Ninh cũng nhiều lần nhận hối lộ của Nguyễn Thị Thanh Nhàn và Công ty Sông Hồng, tổng số 8,1 tỷ đồng. Bị can Quỳnh khai đã chi tiêu cá nhân hết số tiền này.
Khởi tố, tạm giam nguyên Bí thư Tỉnh uỷ Bắc Ninh Nguyễn Nhân Chiến 
Bà Nguyễn Thị Thanh Nhàn đã thâu tóm gói thầu như thế nào? 
