Theo hồ sơ vụ án, đầu năm 2020, dịch COVID-19 đang bùng phát ở Ninh Thuận nên ngành y tế tỉnh này khai thác và huy động nguồn vật tư y tế để xét nghiệm, phòng chống dịch bệnh. Lúc đó, Hội Doanh nghiệp trẻ Ninh Thuận mua tặng CDC Ninh Thuận máy xét nghiệm PCR do Công ty CP Công nghệ Việt Á sản xuất, nên khi lắp đặt máy, Lê Trung Nguyên, nhân viên Việt Á và Nguyễn Quang Tuyến, Phó trưởng khoa xét nghiệm CDC Ninh Thuận thống nhất sử dụng kit test xét nghiệm COVID-19 do Việt Á sản xuất và tài trợ.
Đến tháng 7/2020, ông Tuyến đề xuất Giám đốc CDC Ninh Thuận tiếp tục sử dụng kít test xét nghiệm của Việt Á, nhưng do chưa có kinh phí, nên từ tháng 8/2020 đến tháng 10/2021, Giám đốc và Trưởng phòng Kế hoạch - Tài chính CDC Ninh Thuận thống nhất giao cho Trưởng khoa dược Dương Bá Thanh Dân liên hệ mượn của Việt Á 159.886 kit test xét nghiệm và 90.240 test hóa chất xét nghiệm, có tổng trị giá hơn 72,7 tỷ đồng.
Trong thời gian đó, Giám đốc CDC Ninh Thuận chỉ đạo Dân cùng Trưởng phòng Kế hoạch - Tài chính Dương Thị Yến Trâm hợp thức 5 hồ sơ chỉ định thầu, ký hợp đồng mua bán và thanh toán cho Việt Á hơn 13,6 tỉ đồng. Tuy nhiên toàn bộ hồ sơ nêu trên vi phạm quy định về lập và xác định giá gói thầu; vi phạm quy định các hành vi bị cấm trong đấu thầu theo Luật Đấu thầu năm 2013.
Năm hợp đồng hai bên đã ký kết với giá mỗi kit test xét nghiệm 470.000 - 525.000 đồng, nhưng kết quả điều tra xác định giá thực tế 144.000 - 175.000 đồng, thế nhưng trong hai năm (2020 – 2021), CDC Ninh Thuận đã thanh toán cho Việt Á 13,1 tỷ đồng, gây thiệt hại ngân sách nhà nước 9,1 tỷ đồng.
Cáo trạng của Viện KSND tỉnh Ninh Thuận xác định, ông Nguyễn Nhị Linh, Giám đốc CDC Ninh Thuận đã có hành vi chỉ đạo mượn kit test xét nghiệm của Việt Á để sử dụng trước; chỉ đạo hợp thức hóa hồ sơ đấu thầu, chỉ định thầu trái pháp luật để ký hợp đồng mua bán, thanh toán tiền cho Việt Á là đã cấu thành tội vi phạm quy phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng. Tuy nhiên, ông Linh không vụ lợi, không hưởng lợi từ hành vi sai phạm, xét nguyên nhân, bối cảnh sai phạm, thành tích phòng chống dịch bệnh, thái độ hợp tác các cơ quan chức trách trong phát hiện xử lý tội phạm và các chính sách khoan hồng đặc biệt, cơ quan điều tra không xử lý trách nhiệm hình sự đối với ông Linh.
Hành vi của bà Dương Thị Yến Trâm, Trưởng phòng Kế hoạch – Tài chính CDC Ninh Thuận cũng cấu thành tội phạm, nhưng xuất phát từ chỉ đạo của Giám đốc CDC Ninh Thuận, nên không xử lý trách nhiệm hình sự.
Quá trình điều tra, Lê Trung Nguyên, nhân viên Việt Á khai báo đã đưa hoa hồng cho Dương Bá Thanh Dân và Nguyễn Đăng Đức 1,83 tỷ đồng, nhưng Đức cho rằng chỉ nhận 70 triệu đồng bồi dưỡng cho những người làm hồ sơ đấu thầu và đã giao nộp số tiền này, phần còn lại 1,76 tỷ đồng chưa làm rõ nên cơ quan điều tra tách riêng để tiếp tục giải quyết theo quy định pháp luật.
Vi phạm đấu thầu, cựu Trưởng phòng và Giám đốc doanh nghiệp bị khởi tố 
Xét xử sơ thẩm vụ sai phạm đấu thầu tại Sở y tế Cần Thơ 
