Cáo trạng xác định trong khoảng thời gian từ năm 2012 đến tháng 10-2022, bà Trương Mỹ Lan đã thâu tóm, nắm giữ trên thực tế số lượng cổ phần gần tuyệt đối của Ngân hàng SCB (từ 85% đến 91,5% cổ phần), qua đó trở thành cổ đông có quyền lực để chỉ đạo, điều hành, thực chất là thao túng toàn bộ hoạt động của Ngân hàng SCB, phục vụ cho các mục đích khác nhau của mình.
Cụ thể, từ ngày 1/1/2012 đến ngày 7/10/2022, Trương Mỹ Lan và các đồng phạm đã lập một số lượng lớn các hồ sơ vay vốn khống để rút số tiền đặc biệt lớn. Trong đó: Từ ngày 1/1/2012 đến ngày 31/12/2017, Trương Mỹ Lan đã chỉ đạo lập khống 368 hồ sơ vay vốn để rút tiền của Ngân hàng SCB sử dụng vào các mục đích khác nhau, gây thiệt hại cho Ngân hàng SCB số tiền 64.621 tỉ đồng. Từ ngày 9/2/2018 đến ngày 7/10/2022, Trương Mỹ Lan đã chỉ đạo lập khống 916 hồ sơ vay vốn, chiếm đoạt của Ngân hàng SCB số tiền 304.096 tỉ đồng, gây thiệt hại số tiền 129.372 tỉ đồng.
Ngoài ra, để che giấu thực trạng tài chính đặc biệt yếu kém và các sai phạm của Ngân hàng SCB phát hiện qua thanh tra, để SCB không bị đưa vào diện kiểm soát đặc biệt và tiếp tục được tái cơ cấu, bà Trương Mỹ Lan trực tiếp gặp gỡ bàn bạc, trao đổi với bà Đỗ Thị Nhàn, trưởng đoàn thanh tra, và chỉ đạo ông Võ Tấn Hoàng Văn, tổng giám đốc, tiếp xúc, đặt vấn đề, trực tiếp đưa tiền cho bà Nhàn 5,2 triệu USD và đưa tiền, quà bồi dưỡng các thành viên trong đoàn thanh tra.
Trong phần xét xử sáng 11/3, bị cáo Trương Mỹ Lan là người đầu tiên được tòa gọi xét hỏi. Trả lời câu hỏi của HĐXX, Trương Mỹ Lan phủ nhận vai trò chỉ đạo, điều hành ngân hàng SCB cũng như việc nắm giữ trên 90% cổ phần tại SCB.
Bị cáo Lan cho biết cả gia đình của bà chưa tới 15% cổ phần, trong đó hai con gái mỗi người nắm giữ 5%, riêng bà Lan là 4,9%. Ngoài ra, anh em bạn bè ở nước ngoài là trên 30%, trong nước là trên 30%. “Tất cả những người đang nắm cổ phần đều đứng giùm bị cáo, họ đều đã thừa nhận trong lời khai", Chủ tọa thông tin cho bị cáo Trương Mỹ Lan biết.
Tại phiên tòa, bị cáo Trương Mỹ Lan quanh co nhằm chối tội nhưng sau đó nói bị cáo tôn trọng cáo trạng truy tố. Bà Lan nhiều lần bật khóc, nói rất đau xót khi phải đứng trước tòa ngày hôm nay.
Cũng theo cáo trạng truy tố của VKS nhân dân tối cao, bị cáo Trương Mỹ Lan và đồng phạm, với những vị trí, vai trò khác nhau, thực hiện nhiều tội phạm xâm phạm về sở hữu, xâm phạm hoạt động của ngân hàng, hoạt động đúng đắn của cơ quan nhà nước. Trong đó, nhiều tội phạm được thực hiện dưới dạng đồng phạm có tổ chức, thủ đoạn tinh vi, xảo quyệt, gây hậu quả đặc biệt nghiêm trọng, chiếm đoạt và gây thiệt hại số tiền đặc biệt lớn từ ngân hàng SCB.
Tuần thứ 2 xét xử "đại án" Vạn Thịnh Phát: Tiếp tục xét hỏi Trương Mỹ Lan và các bị cáo còn lại 
