Cơ quan CSĐT Công an TP Hồ Chí Minh đề nghị truy tố các bị can: Nguyễn Minh Quân (nguyên Giám đốc BV TP Thủ Đức), Phạm Vũ Phong (Giám đốc Công ty TNHH Thiết kế xây dựng TM&DV Nam Phong), Trương Thị Bảo Trân (nhân viên Phòng Vật tư trang thiết bị y tế BV TP Thủ Đức) về tội "Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng". Riêng bị can Mai Lệ Quyên (nguyên Trưởng khoa Vi sinh, BV TP Thủ Đức) bị đề nghị truy tố tội "Nhận hối lộ".
Trước đó, Viện KSND TP Hồ Chí Minh yêu cầu cơ quan điều tra xác định cụ thể đơn giá kit xét nghiệm, theo đó xác định chính xác số tiền thiệt hại trong vụ án; củng cố chứng cứ, xem xét trách nhiệm hình sự đối với bị can Mai Lệ Quyên...
Theo kết luận điều tra, với vai trò là Giám đốc BV TP Thủ Đức, giai đoạn cuối năm 2020 và đầu năm 2021, ông Nguyễn Minh Quân đã chỉ đạo cấp dưới hợp thức hóa hồ sơ nhằm thanh toán số lượng kit xét nghiệm COVID-19 cho Công ty Việt Á và Công ty Nam Phong cung ứng trước đó. Việc cung ứng kit xét nghiệm này không có việc thực hiện xem xét năng lực, kinh nghiệm nhà thầu, thực hiện đấu thầu theo quy định. Hồ sơ vụ án thể hiện, hành vi phạm tội của Nguyễn Minh Quân và đồng phạm đã gây thiệt hại cho Bệnh viện TP Thủ Đức gần 10 tỷ đồng. Đây là số tiền Công ty Nam Phong hưởng lợi trong việc Việt Á chiết khấu giá bán kit xét nghiệm.
Kết quả điều tra bổ sung, căn cứ trên kết quả thực nghiệm điều tra của Cơ quan CSĐT Bộ Công an và các đơn vị tiến hành thực nghiệm điều tra toàn bộ quá trình sản xuất kit xét nghiệm của Công ty Việt Á, xác định giá kit xét nghiệm do Công ty Việt Á sản xuất (đã bao gồm 5% lợi nhuận) tối đa là 143.461 đồng/1 test.
Do vậy, thiệt hại trong việc BV TP Thủ Đức mua kit xét nghiệm Việt Á trực tiếp từ Công ty Việt Á là 461 triệu đồng. Thiệt hại trong việc Bệnh viện TP Thủ Đức mua kit xét nghiệm Việt Á từ Công ty Nam Phong là 9,7 tỷ đồng, số tiền Công ty Nam Phong hưởng lợi trong việc Việt Á chiết khấu giá bán kit xét nghiệm.
Theo kết luận điều tra, tháng 5/2020, Mai Lệ Quyên (Kỹ thuật viên trưởng của Khoa Vi sinh, được bổ nhiệm Trưởng khoa Vi sinh vào tháng 7/2021) được Nguyễn Minh Quân chỉ đạo chuẩn bị phòng xét nghiệm COVID-19 theo tiêu chuẩn Bộ Y tế. Quyên cùng nhân viên Khoa Vi sinh thực hiện những việc xây dựng phòng xét nghiệm, đào tạo nhân sự, máy móc trang thiết bị để chuẩn bị cho việc thẩm định năng lực xét nghiệm COVID-19 của Viện Pasteur TP Hồ Chí Minh.
Khoảng tháng 6/2020, Ngô Đặng Quốc Định là Trưởng khoa Vi sinh (đã nghỉ việc tháng 4/2021 và xuất cảnh đi Mỹ định cư) nói với Quyên có nhân viên của Công ty Việt Á muốn gặp để giới thiệu về sản phẩm kit xét nghiệm COVID-19 của Việt Á và yêu cầu Quyên nghiên cứu triển khai sử dụng sản phẩm của Việt Á có phù hợp, chạy có kết quả hay không. Sau đó, Quyên gặp và được Lê Trung Nguyên tự giới thiệu là nhân viên bán hàng của Công ty Việt Á, được phân công giới thiệu bán kit xét nghiệm và hỗ trợ kỹ thuật xét nghiệm.
Ngày 4/8/2020, Khoa Vi sinh BV Thủ Đức ban hành quy trình xét nghiệm sàng lọc COVID-19 bằng phương pháp Realtime PT-PCR do Mai Lệ Quyên đề xuất và được Nguyễn Minh Quân phê duyệt. Từ tháng 8 đến tháng 9/2020, BV Thủ Đức bắt đầu sử dụng kit xét nghiệm Việt Á. Ngày 25/9/2020, BV Thủ Đức chính thức được Viện Pasteur TP Hồ Chí Minh công nhận đủ năng lực xét nghiệm khẳng định COVID-19.
Theo kết luận, Mai Lệ Quyên là người quyết định chọn mua loại kit xét nghiệm và hóa chất. Quyên lựa chọn kit xét nghiệm Việt Á tên là LightPower SARS-CoV-2 RT-PCR kit với lý do thời điểm đó không có đơn vị nào khác sản xuất kit xét nghiệm.
Khoảng đầu tháng 8/2021, Lê Trung Nguyên chủ động gọi điện thoại cho Quyên và nói Công ty Việt Á muốn hỗ trợ kinh phí cho anh em trong Khoa Vi sinh BV Thủ Đức thông qua Quyên do vất vả chống dịch. Nguyên xin số tài khoản của chồng Quyên để chuyển tiền. Quyên đồng ý và cho Nguyên số tài khoản chồng mình. Ngày 5/8/2021, Nguyên chuyển khoản 100 triệu đồng cho Quyên thông qua tài khoản trên.
Lê Trung Nguyên trình bày rằng việc chi tiền cho Quyên là thực hiện chỉ đạo của Phan Quốc Việt, Giám đốc Công ty Việt Á - về việc chi bồi dưỡng cho các cá nhân trực tiếp sử dụng kit xét nghiệm Việt Á. Trước khi chuyển tiền cho Quyên, Nguyên có điện thoại với Quyên trao đổi sẽ chi 100 triệu đồng bồi dưỡng cho Quyên và Quyên đồng ý.
Sau khi nhận 100 triệu đồng từ Nguyên, Quyên khai đã lấy 60 triệu đồng chi cho các nhân viên trong Khoa Vi sinh và 40 triệu đồng để mua sinh phẩm phục vụ xét nghiệm cho BV TP Thủ Đức nhưng Quyên chưa cung cấp được chứng từ. Quá trình điều tra, Quyên đã nộp lại số tiền 100 triệu đồng vào tài khoản tạm giữ của Cơ quan CSĐT Công an TP Hồ Chí Minh.
Khởi tố Giám đốc Bệnh viện TP Thủ Đức và đồng bọn vi phạm quy định về đấu thầu 
Nguyên Giám đốc Bệnh viện Thủ Đức liên quan kit xét nghiệm Việt Á bị đề nghị truy tố 
