Quân đội Mỹ cũng điều tra xem liệu những vụ vận chuyển ma túy và vũ khí bất hợp pháp có liên quan gì đến vụ đại tá Ahmed Gul của AAF nổ súng bắn chết trung tá Frank Bryant và 8 sĩ quan Không quân Mỹ ở sân bay Kabul hồi tháng 4/2011 hay không.
Theo bản báo cáo dày 436 trang được Không quân Mỹ tiết lộ vào đầu năm, đại tá Ahmed Gul của AAF được cho là dính líu đến hoạt động vận chuyển hàng hóa cấm nên muốn giết người để ngăn cản một cuộc điều tra về vụ việc xảy ra. Trung tá Mohammed Bahadur, người phát ngôn của AAF, bác bỏ mọi ám chỉ và tuyên bố ông không nhận được thông tin về bất cứ cuộc điều tra nào nhằm vào AAF. Kể cả Bộ trưởng Quốc phòng Afghanistan - tướng Abdul Rahim Wardak - cũng không hề biết gì về những cuộc điều tra của Mỹ.
Riêng giới quan chức phương Tây cũng cho rằng một bộ phận của chính quyền Afghanistan có thể có dính líu đến hoạt động vận chuyển ma túy và vũ khí trái phép trong nước hoặc cố tình nhắm mắt làm ngơ trước vấn đề phạm pháp. Cuộc điều tra của Mỹ hiện chỉ mới ở giai đoạn đầu và không có sự tham gia của người
Theo số liệu của Liên Hiệp Quốc (LHQ), sản lượng thuốc phiện bất hợp pháp của
Các nhà điều tra Mỹ cho biết, hiện tại họ chưa phát hiện bằng chứng nào đủ mạnh cho thấy các sĩ quan AAF câu kết với các mạng lưới buôn ma túy quốc tế. Về phần mình, quan chức DEA không xác định hay phủ nhận vai trò của họ trong cuộc điều tra và cũng từ chối bình luận sâu hơn. Trung tá Frank Bryant của không quân Mỹ, cố vấn cho AAF, tự tổ chức một cuộc điều tra ban đầu và không chính thức sau nhiều tháng quan sát thấy một số máy bay trực thăng của AAF không nằm trong lịch bay mà vẫn biến mất một cách khó hiểu.
Vào đầu năm 2011, trung tá Bryant quyết định áp đặt sự kiểm soát của Mỹ đối với kế hoạch bay của Không quân Afghanistan và đề nghị ngưng cung cấp nhiên liệu cho AAF cho đến khi lực lượng này cải thiện được tính minh bạch về những hướng bay và hàng hóa vận chuyển. Người Mỹ đặc biệt nghi ngờ về cầu thang hàng hóa số 5 tại sân bay
Sân bay
Người ta cho rằng động cơ giết người của đại tá Gul là nhằm ngăn cản cuộc điều tra về hoạt động vận chuyển ma túy và vũ khí bất hợp pháp của AAF. Bạn bè và gia đình của đại tá Gul khẳng định ông không phải là phần tử cực đoan hay khủng bố, đồng thời nhấn mạnh ông có vấn đề về tài chính cũng như xích mích với các sĩ quan quân đội Mỹ. Họ cũng bác bỏ cáo buộc cho rằng đại tá Gul dính líu đến các hoạt động phi pháp và tham nhũng. Một trung tá Mỹ không được nêu tên cho biết một số sĩ quan cao cấp
Tháng 4/2011, một người phát ngôn của liên quân Mỹ không đưa ra câu trả lời cuối cùng về động cơ nổ súng của đại tá Ahmed Gul nhưng cho rằng người này có bất đồng với lực lượng liên quân. Quan chức NATO cũng cho rằng hơn một nửa số vụ việc quân nhân Afghanistan nổ súng nhằm vào lực lượng liên quân là hậu quả của những sự tranh cãi cá nhân, song phủ nhận việc Taliban tuyên bố đại tá Gul là người của họ cài vào quân đội Afghanistan. Ngoài hướng điều tra nhằm vào những vụ vận chuyển hàng hóa bất hợp pháp tại khu vực cầu thang số 5, các nhà điều tra Mỹ còn quan tâm theo dõi mọi hoạt động ở những sân bay quân sự khác thuộc quyền sử dụng của AAF, nhất là những sân bay nằm gần khu vực biên giới phía bắc Afghanistan.
Miền Bắc